De 3. Liga 2013/14 is het zesde seizoen van het vernieuwde derde voetbalniveau in het Duitsevoetbalsysteem. De competitie ging van start op 19 juli 2013 en zal eindigen op 10 mei 2014.
In tegenstelling tot het vorige seizoen waren er 2 wijzigingen in de teams:
MSV Duisburg kreeg geen licentie voor de 2e Bundesliga, vanwege financiële problemen, en moest daardoor een klasse lager voetballen. SV Sandhausen zou eigenlijk degraderen uit de 2e Bundesliga, maar door MSV bleven ze erin.
De twee teams die aan het eind van het seizoen als 1e en 2e zijn geëindigd, promoveren direct naar de 2e Bundesliga. Nummer 3 speelt twee duels met de nummer 16 van de 2e Bundesliga. De winnaar promoveert of blijft in de 2e Bundesliga.
De drie teams die aan het eind van het seizoen op de laatste drie plaatsen staan (18, 19 en 20) degraderen direct naar de Regionalliga.
De vier teams die aan het eind van het seizoen bij de eerste vier horen kwalificeren zich voor de DFB-Pokal van 2014/15.