Dalam kejohanan ini, 11 pasukan teratas daripada saingan Liga Super 2022,[3] disertai oleh 5 pasukan teratas dari saingan Liga Premier 2022 (bukan pasukan pelapis kelab dan pembangunan) layak menyertai. Tiada perlawanan peringkat kumpulan dalam kejohanan kali ini, pasukan akan terus bermain dalam peringkat kalah mati. Kesemua perlawanan peringkat kalah mati iatu pusingan 16, suku akhir dan separuh akhir akan dimainkan di tempat sendiri dan tempat lawan dan perlawanan akhir akan dimainkan satu perlawanan tunggal di venue berkecuali.[4][5] Bermula edisi 2022, MFL memutuskan untuk tidak lagi menggunakan sistem peraturan gol tempat lawan di peringkat kalah mati untuk pusingan 16, suku akhir dan separuh akhir,[6] jika pasukan terikat pada agregat di masa biasa, masa tambahan dan penalti akan digunakan untuk menentukan pemenang jika perlu.
Majlis undian akan diadakan pada 6 Oktober 2022, jam 15:00 (MST) yang disiarkan secara langsung di youtubeMFL.[7][8] Balang A akan diisi oleh empat pasukan teratas Liga Super, balang B diisi oleh pasukan tempat ke-5 dan ke-6 Liga Super termasuk 2 pasukan teratas Liga Premier dan balang C diisi oleh pasukan tempat ke-7 hingga ke-11 Liga Super termasuk 3 pasukan selebihnya dari Liga Premier yang layak.
Dalam fasa kalah mati, pasukan bermain menentang satu sama lain melalui perlawanan timbal balik di tempat sendiri dan tempat lawan, kecuali perlawanan akhir. Peraturan gol tempat lawan di peringkat kalah mati (pusingan 16, suku akhir dan separuh akhir) tidak akan digunakan,[6] sekiranya pasukan terikat pada agregat di masa biasa, masa tambahan dan penalti akan digunakan untuk menentukan pemenang jika perlu.
^Ahli Lembaga Pengarah dari Liga Bola Sepak Malaysia (MFL) telah mencapai keputusan untuk tidak membenarkan Melaka United FC (MUFC) yang kini bermain di liga super untuk mengambil bahagian dalam TM Piala Malaysia 2022. Ini adalah disebabkan kerana kegagalan dalam menyelesaikan masalah tunggakkan gaji kepada para pemain dan pegawai mereka. Oleh itu kesemua 11 pasukan dari Liga Super akan mengisi slot TM Piala Malaysia 2022 selepas satu daripadanya telah ditinggalkan oleh Melaka United FC (MUFC).[3]