Perdana Menteri Estonia (bahasa Estonia : peaminister, secara harfiah Menteri Utama atau Ketua Menteri) ialah ketua kerajaanRepublik Estonia . Perdana Menteri dicalonkan oleh Presiden setelah berunding sewajarnya dengan puak parlimen dan disahkan oleh Parlimen. Sekiranya tidak bersetuju, Parlimen boleh menolak pencalonan Presiden dan memilih calon mereka sendiri. Pada praktiknya, oleh kerana Perdana Menteri mesti menjaga keyakinan Parlimen untuk terus memegang jawatan, beliau biasanya pemimpin rakan kanan dalam gabungan pemerintah. Perdana Menteri sekarang ialah Kristen Michal dari Parti Reformasi. Beliau mula menjawat pada 23 Julai 2024.