San Markoso departamentas (isp.Departamento de San Marcos) – departamentas Gvatemalos vakarinėje dalyje, Meksikos pasienyje, siauru ruožu siekia Ramųjį vandenyną. Administracinis centras – San Markosas.
Šiaurinę departamento dalį užima Čiapaso Siera Madrės kalnai. Juose stūkso aukščiausia šalies viršūnė – Tachumulkas (4220 m), bei Takanos ugnikalnis (4092 m). Einant į pietus paviršius leidžiasi į pakrantės lygumą. Upės neilgos, bet vandeningos, neša savo vandenis nuo kalnų į vandenyną: Sučiatė, Kabusas, Naranchas, Nahuatanas, Tilapa, Koatanas, Kuilkas ir kt. Kalnų pašlaitėse auga tropiniai drėgnieji miškai, lygumoje būdingi sausi subtropikų krūmynai.