Pamyro Alajus – kalnų sistema Centrinėje Azijoje, kurį sudaro trys dalys: Gisaro Alajaus kalnagūbris, Tadžikijos žemuma ir Pamyro kalnai.
Šis kalnų masyvas yra tarp Ferganos slėnio šiaurėje ir Amudarjos aukštupio (Piandžas-Vachandarja) pietuose. Didžioji jo dalis yra Tadžikijoje, šiaurrytinė dalis – Kirgizijoje, vakarinė – Uzbekijoje. Rytinis ir dalis pietinio Pamyro kalnų masyvo pakraščiai siekia Kiniją ir Afganistaną.
