겐큐 원년 (1190년) 4월 20일, 고령의 나이로 출산에 의한 난산이 원인이 되어 향년 46세 (또는 36세)의 나이로 사망했다. 요리토모가 깊이 슬퍼한 것이 『아즈마카가미(吾妻鏡)』에 잘 나타나있다. 또한, 추선법요가 가마쿠라의 쇼쵸쥬인에서 행해진 사실도 『아즈마카가미(吾妻鏡)』에 기재되어 있다.
많은 자료를 통해, 요리토모의 여동생 설이 유력하지만, 『아즈마카가미(吾妻鏡)』 겐큐 원년 (1190년) 4월 20일조에 적힌 향년 46세에서 역산하면 1145년생으로, 1147년생인 요리토모의 누나가 된다. 『헤이지모노가타리(平治物語)』에서는 헤이지의 난 (헤이지 원년 (1159년) 12월 9일) 때, < 올해 6살이 된다 > 라고 쓰여있다. 보몬히메의 생년에 대해서는 예로부터 학자 간에 논쟁이 있어, 츠노다 분에이 ("미나모토노 요리토모의 동생" 『왕조의 명암(王朝の明暗)』, 1975년)는 46세의 산욕로 인한 사망은 부자연스러우며, 『아즈마카가미』에 쓰여진 향년 卌六(46)은 卅六(36)의 오기이며, 『헤이지모노가타리』에 쓰여진 연령에 따른다고 하였다. 누키 타츠토 ("다시 이치죠 요시야스의 아내는 미나모토노 요리토모의 동생인가" 『가마쿠라(鎌倉)』 84, 1997년)는 『아즈마카가미』에 쓰여진 향년을 중시하고, 그에 따른다고 했다.