RNA 목록

RNA 또는 리보핵산(영어: ribonucleic acid)은 생물체 내에서 다양한 형태로 존재하며 다양한 역할을 수행한다. 역할별로 그룹화된 RNA 종류는 다음과 같다. 다양한 종류의 RNA에 대한 약어를 나열하고 설명한다.

역할에 따른 구분

단백질 합성에 관여하는 RNA
종류 약어 기능 분포 참조
전령 RNA mRNA 단백질을 암호화하고 있음 모든 생물체
리보솜 RNA rRNA 번역 모든 생물체
신호인식입자 RNA 7SL RNA 또는 SRP RNA 막 통합 모든 생물체 [1]
운반 RNA tRNA 번역 모든 생물체
운반-전령 RNA tmRNA 정지된 리보솜 구출 세균 [2]
전사 후 변형 또는 DNA 복제에 관련된 RNA
종류 약어 기능 분포 참조
소형 핵 RNA snRNA 스플라이싱 및 기타 기능 진핵생물 및 고세균 [3]
소형 핵소체 RNA snoRNA RNA의 뉴클레오타이드 변형 진핵생물 및 고세균 [4]
SmY RNA SmY mRNA 트랜스 스플라이싱 선형동물 [5]
소형 카할체 특이 RNA scaRNA snoRNA의 종류, RNA의 뉴클레오타이드 변형
가이드 RNA gRNA mRNA 뉴클레오타이드 변형 운동핵편모충류 미토콘드리아 [6]
리보뉴클레이스 P RNase P tRNA 성숙 모든 생물체 [7]
리보뉴클레이스 MRP RNase MRP rRNA 성숙, DNA 복제 진핵생물 [8]
Y RNA RNA 프로세싱, DNA 복제 동물 [9]
텔로머레이스 RNA 요소 TERC 텔로미어 합성 대부분의 진핵생물 [10]
슬라이스 리더 RNA SL RNA mRNA 트랜스 스플라이싱, RNA 프로세싱
조절 RNA
종류 약어 기능 분포 참조
안티센스 RNA aRNA, asRNA 전사 감쇠, mRNA 분해, mRNA 안정화, 번역 차단 모든 생물체 [11][12]
시스-내추럴 안티센스 전사체 cis-NAT 유전자 조절
CRISPR RNA crRNA 기생충에 대한 저항성은 DNA를 표적으로 삼아 이루어진다. 세균 및 고세균 [13]
긴 비번역 RNA lncRNA 유전자 전사 조절, 후성유전학적 조절 진핵생물
마이크로RNA miRNA 유전자 조절 대부분의 진핵생물 [14]
피위-상호작용 RNA piRNA 트랜스포존 방어, 아마도 다른 기능 대부분의 동물 [15][16]
소형 간섭 RNA siRNA 유전자 조절 대부분의 진핵생물 [17]
짧은 헤어핀 RNA shRNA 유전자 조절 대부분의 진핵생물 [18]
트랜스-액팅 siRNA tasiRNA 유전자 조절 육상 식물 [19]
반복 연관 siRNA rasiRNA piRNA의 종류, 트랜스포존 방어 초파리속 [20]
7SK RNA 7SK CDK9/사이클린 T 복합체를 음성적으로 조절함
인핸서 RNA eRNA 유전자 조절 [21]
기생성 RNA
종류 기능 분포 참조
레트로트랜스포존 자체 전파 진핵생물 및 일부 세균 [22]
바이러스 게놈 정보 운반자 이중가닥 RNA 바이러스, 양성가닥 RNA 바이러스, 음성가닥 RNA 바이러스, 많은 위성 바이러스 및 레트로바이러스
바이로이드 자체 전파 감염된 식물 [23]
위성 RNA 자체 전파 감염된 세포
기타 RNA
종류 약어 기능 분포 참조
볼트 RNA vRNA, vtRNA 생체이물의 배출 (추측) [24]
글리코RNA - 불명

RNA 약어

약어 이름 패밀리 설명 참조
ncRNA 비번역 RNA -
nmRNA 비전령 RNA - ncRNA의 동의어
sRNA 소형 RNA - ncRNA의 동의어
smnRNA 소형 비전령 RNA - ncRNA의 동의어
tRNA 운반 RNA RF00005
sRNA 가용성 RNA - tRNA의 동의어
mRNA 전령 RNA -
pcRNA 단백질 코딩 RNA - mRNA의 동의어
rRNA 리보솜 RNA 다중 패밀리
5S rRNA 5S 리보솜 RNA RF00001
5.8S rRNA 5.8S 리보솜 RNA RF00002
SSU rRNA 작은 소단위체 리보솜 RNA CL00111
LSU rRNA 큰 소단위체 리보솜 RNA CL00112
NoRC RNA 핵소체 리모델링 복합체 관련 RNA RF01518
pRNA 프로모터 RNA RF01518 NoRC RNA의 동의어
6S RNA 6S RNA RF00013
SsrS RNA RF00013 6S RNA의 동의어
aRNA 안티센스 RNA - asRNA의 동의어
asRNA 안티센스 RNA -
asmiRNA 안티센스 마이크로RNA -
cis-NAT cis-자연적 안티센스 전사체 - 표적과 동일한 게놈 위치에서 전사되지만 반대 DNA 가닥에서 전사되어 완벽한 쌍을 형성하는 자연적 안티센스 전사체
crRNA CRISPR RNA -
tracrRNA 트랜스-활성화 crRNA -
CRISPR RNA CRISPR-Cas RNA 다중 패밀리
DD RNA DNA 손상 반응 RNA - DNA 손상 반응을 활성화하는 RNA
diRNA DSB 유도 소형 RNA -
dsRNA 이중가닥 RNA -
endo-siRNA 내인성 소형 간섭 RNA -
exRNA 세포외 RNA -
gRNA 가이드 RNA -
hc-siRNA 이질염색질 소형 간섭 RNA -
hcsiRNA 이질염색질 소형 간섭 RNA - hc-siRNA의 동의어
hnRNA 이종 핵 RNA - pre-mRNA의 동의어 (엄격한 의미에서 세포질 mRNA로 끝나지 않는 핵 RNA 전사체를 포함할 수 있다)
RNAi RNA 간섭 - RNA가 표적 mRNA 분자를 중화시켜 유전자 발현이나 번역을 억제하는 과정
lincRNA 긴 유전자간 비번역 RNA -
lncRNA 긴 비번역 RNA -
miRNA 마이크로RNA 다중 패밀리
mrpRNA 미토콘드리아 RNA 프로세싱 리보뉴클레이스 - RNase MRP의 동의어
nat-siRNA 자연적 안티센스 짧은 간섭 RNA - natsiRNA의 동의어
natsiRNA 자연적 안티센스 짧은 간섭 RNA - 길이가 21~24 nt 사이인 내인성 RNA 조절인자는 상보적인 mRNA 전사체로부터 생성되며, 이는 추가적으로 siRNA로 가공된다.
OxyS RNA 산화 스트레스 반응 RNA RF00035 대장균(Escherichia coli)의 산화 스트레스에 반응하여 유도되는 소형 비번역 RNA
piRNA 피위-상호작용 RNA 다중 패밀리 동물 세포에서 piwi 단백질과 RNA-단백질 복합체를 형성하는 소형 RNA
qiRNA QDE-2 간섭 RNA -
rasiRNA 반복 연관 siRNA - RNA 간섭 경로에 관여하는 소형 RNA로 piRNA의 한 종류
RNase MRP 미토콘드리아 RNA 프로세싱 리보뉴클레이스 RF00030
RNase P 리보뉴클레이스 P RF00010 RNA를 절단하는 리보뉴클레이스의 한 종류
scaRNA 소형 카할체 특이 RNA RF00553
scnRNA 소형 스캔 RNA -
scRNA 소형 세포질 RNA -
scRNA 소형 조건부 RNA -
SgrS RNA 당 수송 관련 sRNA RF00534 포도당-인산 스트레스 동안 대장균에서 SgrR에 의해 활성화되는 소형 RNA
shRNA 짧은 헤어핀 RNA -
siRNA 소형 간섭 RNA -
SL RNA 스플라이스 리더 RNA 다중 패밀리
SmY RNA mRNA 트랜스 스플라이싱 RF01844 일부 선형동물에서 발견된 소형 핵 RNA는 mRNA 트랜스 스플라이싱에 관여하는 것으로 생각된다.
snoRNA 소형 핵소체 RNA 다중 패밀리
snRNA 소형 핵 RNA 다중 패밀리
snRNP 소형 핵 리보핵산단백질 -
SPA lncRNA 5' 소형 핵소체 RNA 캡핑 및 3' 폴리아데닐화 긴 비번역 RNA -
SRP RNA 신호인식입자 RNA CL00003
ssRNA 단일가닥 RNA -
stRNA 소형 시간적 RNA -
tasiRNA 트랜스-액팅 siRNA -
tmRNA 운반-전령 RNA RF00023 tRNA 유사 특성 및 mRNA 유사 특성을 이중적으로 가지고 있는 세균의 RNA 분자
uRNA U 스플라이소좀 RNA 다중 패밀리
vRNA 볼트 RNA - vtRNA의 동의어
vtRNA 볼트 RNA RF00006
Xist RNA X-불활성화 특이 전사체 -
Y RNA Y RNA RF00019 Ro60 리보핵산단백질 입자의 구성 요소이며 염색질 및 개시 단백질과의 상호작용을 통한 DNA 복제에 필요하다.
NATs 자연적 안티센스 전사체 - 다른 RNA 전사체와 전사체 상보성을 갖는 세포 내에 암호화된 자연적 안티센스 전사체
pre-mRNA 전구체 전령 RNA - 전령 RNA의 미성숙 단일가닥
circRNA 원형 RNA -
msRNA 다중복사, 단일가닥 RNA - 항파지 항독소 역할을 하는 RT-msDNA 복합체를 형성하는 레트론 암호화 역전사 효소의 산물 [25][26]
cfRNA 세포-유리 RNA -

같이 보기

각주

  1. ↑ Gribaldo S, Brochier-Armanet C (2006). “The origin and evolution of Archaea: a state of the art”. 《Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci》 361 (1470): 1007–22. doi:10.1098/rstb.2006.1841. PMC 1578729. PMID 16754611. 
  2. ↑ Gillet R, Felden B (2001). “Emerging views on tmRNA-mediated protein tagging and ribosome rescue”. 《Molecular Microbiology》 42 (4): 879–85. doi:10.1046/j.1365-2958.2001.02701.x. PMID 11737633. S2CID 45056681. 
  3. ↑ Thore S, Mayer C, Sauter C, Weeks S, Suck D (2003). “Crystal Structures of the Pyrococcus abyssi Sm Core and Its Complex with RNA”. 《J. Biol. Chem.》 278 (2): 1239–47. doi:10.1074/jbc.M207685200. PMID 12409299. 
  4. ↑ Kiss T (2001). “Small nucleolar RNA-guided post-transcriptional modification of cellular RNAs”. 《The EMBO Journal》 20 (14): 3617–22. doi:10.1093/emboj/20.14.3617. PMC 125535. PMID 11447102. 
  5. ↑ Jones TA, Otto W, Marz M, Eddy SR, Stadler PF (2009). “A survey of nematode SmY RNAs”. 《RNA Biol》 6 (1): 5–8. doi:10.4161/rna.6.1.7634. PMID 19106623. S2CID 32095624. 
  6. ↑ Alfonzo JD, Thiemann O, Simpson L (1997). “The mechanism of U insertion/deletion RNA editing in kinetoplastid mitochondria”. 《Nucleic Acids Research》 25 (19): 3751–59. doi:10.1093/nar/25.19.3751 (년 이후로 접속 불가 2024-11-01). PMC 146959. PMID 9380494. 
  7. ↑ Pannucci JA, Haas ES, Hall TA, Harris JK, Brown JW (1999). “RNase P RNAs from some Archaea are catalytically active”. 《Proc Natl Acad Sci USA》 96 (14): 7803–08. Bibcode:1999PNAS...96.7803P. doi:10.1073/pnas.96.14.7803. PMC 22142. PMID 10393902. 
  8. ↑ Woodhams MD, Stadler PF, Penny D, Collins LJ (2007). “RNase MRP and the RNA processing cascade in the eukaryotic ancestor”. 《BMC Evolutionary Biology》 7 (Suppl 1): S13. Bibcode:2007BMCEE...7S..13W. doi:10.1186/1471-2148-7-S1-S13. PMC 1796607. PMID 17288571. 
  9. ↑ Perreault J, Perreault JP, Boire G (2007). “Ro-associated Y RNAs in metazoans: evolution and diversification”. 《Molecular Biology and Evolution》 24 (8): 1678–89. doi:10.1093/molbev/msm084. PMID 17470436. 
  10. ↑ Lustig AJ (1999). “Crisis intervention: The role of telomerase”. 《Proc Natl Acad Sci USA》 96 (7): 3339–41. Bibcode:1999PNAS...96.3339L. doi:10.1073/pnas.96.7.3339. PMC 34270. PMID 10097039. 
  11. ↑ Brantl S (2002). “Antisense-RNA regulation and RNA interference”. 《Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression》 1575 (1–3): 15–25. doi:10.1016/S0167-4781(02)00280-4. PMID 12020814. 
  12. ↑ Brantl S (2007). “Regulatory mechanisms employed by cis-encoded antisense RNAs”. 《Curr. Opin. Microbiol.》 10 (2): 102–9. doi:10.1016/j.mib.2007.03.012. PMID 17387036. 
  13. ↑ Brouns SJ, Jore MM, Lundgren M, 외. (August 2008). “Small CRISPR RNAs guide antiviral defense in prokaryotes”. 《Science》 321 (5891): 960–4. Bibcode:2008Sci...321..960B. doi:10.1126/science.1159689. PMC 5898235. PMID 18703739. 
  14. ↑ Lin SL, Miller JD, Ying SY (2006). “Intronic microRNA (miRNA)”. 《Journal of Biomedicine and Biotechnology》 2006 (4): 1–13. doi:10.1155/JBB/2006/26818. PMC 1559912. PMID 17057362. 
  15. ↑ Horwich MD, Li C, Matranga C, Vagin V, Farley G, Wang P, Zamore PD (2007). “The Drosophila RNA methyltransferase, DmHen1, modifies germline piRNAs and single-stranded siRNAs in RISC”. 《Current Biology》 17 (14): 1265–72. Bibcode:2007CBio...17.1265H. doi:10.1016/j.cub.2007.06.030. PMID 17604629. S2CID 18880444. 
  16. ↑ Ghildiyal M, Zamore PD (February 2009). “Small silencing RNAs: an expanding universe”. 《Nat. Rev. Genet.》 10 (2): 94–108. doi:10.1038/nrg2504. PMC 2724769. PMID 19148191. 
  17. ↑ Ahmad K, Henikoff S (2002). “Epigenetic consequences of nucleosome dynamics”. 《Cell》 111 (3): 281–84. doi:10.1016/S0092-8674(02)01081-4. PMID 12419239. S2CID 17735718. 
  18. ↑ Ahmad K, Henikoff S (2002). “Epigenetic consequences of nucleosome dynamics”. 《Cell》 111 (3): 281–84. doi:10.1016/S0092-8674(02)01081-4. PMID 12419239. S2CID 17735718. 
  19. ↑ Vazquez F, Vaucheret H (2004). “Endogenous trans-acting siRNAs regulate the accumulation of Arabidopsis mRNAs”. 《Mol. Cell》 16 (1): 69–79. doi:10.1016/j.molcel.2004.09.028. PMID 15469823. 
  20. ↑ Desset S, Buchon N, Meignin C, Coiffet M, Vaury C (2008). Volff JN, 편집. “In Drosophila melanogaster the COM locus directs the somatic silencing of two retrotransposons through both Piwi-dependent and -independent pathways”. 《PLOS ONE》 3 (2): e1526. Bibcode:2008PLoSO...3.1526D. doi:10.1371/journal.pone.0001526. PMC 2211404. PMID 18253480. 
  21. ↑ Li, Wenbo; Notani, Dimple; Rosenfeld, Michael G. (2016년 3월 7일). “Enhancers as non-coding RNA transcription units: recent insights and future perspectives”. 《Nature Reviews. Genetics》 (Springer Nature) 17 (4): 207–223. doi:10.1038/nrg.2016.4. ISSN 1471-0056. PMID 26948815. S2CID 215371. 
  22. ↑ Boeke JD (2003). “The unusual phylogenetic distribution of retrotransposons: a hypothesis”. 《Genome Research》 13 (9): 1975–83. doi:10.1101/gr.1392003. PMID 12952870. 
  23. ↑ Flores R, Hernández C, Martínez de Alba AE, Daròs JA, Di Serio F (2005). “Viroids and viroid-host interactions”. 《Annual Review of Phytopathology》 43: 117–39. doi:10.1146/annurev.phyto.43.040204.140243. PMID 16078879. 
  24. ↑ Gopinath SC, Matsugami A, Katahira M, Kumar PK (2005). “Human vault-associated non-coding RNAs bind to mitoxantrone, a chemotherapeutic compound”. 《Nucleic Acids Res.》 33 (15): 4874–81. doi:10.1093/nar/gki809. PMC 1201340. PMID 16150923. 
  25. ↑ Simon, Dawn M.; Zimmerly, Steven (2008년 11월 12일). “A diversity of uncharacterized reverse transcriptases in bacteria”. 《Nucleic Acids Research》 (영어) 36 (22): 7219–7229. doi:10.1093/nar/gkn867. ISSN 1362-4962. PMC 2602772. PMID 19004871. 
  26. ↑ Bobonis, Jacob; Mitosch, Karin; Mateus, André; Karcher, Nicolai; Kritikos, George; Selkrig, Joel; Zietek, Matylda; Monzon, Vivian; Pfalz, Birgit; Garcia-Santamarina, Sarela; Galardini, Marco; Sueki, Anna; Kobayashi, Callie; Stein, Frank; Bateman, Alex (2022년 9월 1일). “Bacterial retrons encode phage-defending tripartite toxin–antitoxin systems” (PDF). 《Nature》 (영어) 609 (7925): 144–150. Bibcode:2022Natur.609..144B. doi:10.1038/s41586-022-05091-4. ISSN 0028-0836. PMID 35850148. S2CID 250643138. 

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