1999년 UEFA 슈퍼컵(1999 UEFA Super Cup)은 1999년 8월 27일에 열린 24번째 UEFA 슈퍼컵 대회이다. 모나코에 위치한 스타드 루이 II에서 단판 승부 형식으로 진행되었으며 1998-99년 UEFA 챔피언스리그 우승 팀인 맨체스터 유나이티드와 1998-99년 UEFA 컵위너스컵 우승 팀인 라치오가 맞붙었다.
이 대회는 UEFA 챔피언스리그 우승 팀과 UEFA 컵위너스컵 우승 팀이 맞붙은 마지막 UEFA 슈퍼컵이다. 이는 UEFA 컵위너스컵이 1998-99 시즌을 끝으로 폐지되어 UEFA컵(현재의 UEFA 유로파리그)에 통합되었기 때문이다. 라치오가 맨체스터 유나이티드를 1-0으로 누르고 우승을 차지했다.
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