1871年、44歳の時に『Ein Blatt auf Vrony's Grab』をドイツの出版社にて匿名で出版。ヨハンナにとってのデビュー作品である。ただし、この作品は母の友人の牧師から依頼され執筆したもので、売上は普仏戦争の傷病兵看護にあたる女性たちへの支援として全額寄付するという、社会奉仕的な出版であった。
1880年、代表作となる『アルプスの少女ハイジ』の第1部『Heidis Lehr- und Wanderjahre(ハイジの修行時代と遍歴時代)』を匿名で出版。翌1881年には、続編の『Heidi kann brauchen, was es gelernt hat(ハイジは習ったことを使うことができる)』を実名にて出版する。
1872, Verirrt und gefunden(Aus dem Leben)(Erzählband)
1878, Heimathlos.(mit den Erzählungen Am Silser- und am Gardasee und Wie Wiseli's Weg gefunden wird)
1879, Aus Nah und Fern.(mit den Erzählungen Der Mutter Lied und Peppino, fast eine Räubergeschichte)
1879, Verschollen, nicht vergessen. Ein Erlebnis, meinen guten Freundinnen, den jungen Mädchen
1880, „Heidi's Lehr- und Wanderjahre.“
1880, Im Rhonethal
1880, Aus unserem Lande.(mit den Erzählungen Daheim und wieder draussen und Wie es in Waldhausen zugeht)
1881, Am Sonntag
1881, „Heidi kann brauchen, was es gelernt hat.“
1881, Ein Landaufenthalt von Onkel Titus.
1882, Kurze Geschichten für Kinder und auch für Solche, welche die Kinder lieb haben.(mit den Erzählungen Beim Weiden-Joseph, Rosen-Resli, Der Toni von Kandergrund, Und wer nur Gott zum Freunde hat, dem hilft er allerwegen! und In sicherer Hut)
1883, Wo Gritlis Kinder hingekommen sind.
1883, Zwei Volksschriften(mit den Texten Ein goldener Spruch und Wie einer dahin kam, wo er nicht hin wollte)
1884, Gritlis Kinder kommen weiter.
1885, Aus dem Leben eines Advocaten
1886 Kurze Geschichten für Kinder und auch für Solche, welche die Kinder lieb haben. Zweiter Band.(mit den Erzählungen Moni der Geissbub, Was der Grossmutter Lehre bewirkt, Vom This, der doch etwas wird, Am Felsensprung und Was Sami mit den Vögeln singt)
1887, Was soll denn aus ihr werden? Eine Erzählung für junge Mädchen
1888, Arthur und Squirrel.
1888, Aus den Schweizer Bergen.(mit den Erzählungen In Hinterwald, Die Elfe von Intra und Vom fröhlichen Heribli)
1889, Was aus ihr geworden ist. Eine Erzählung für junge Mädchen.
1890, Cornelli wird erzogen.
1891, Volksschriften von Johanna Spyri. Zweiter Band.(mit den Texten In Leuchtensee und Wie es mit der Goldhalde gegangen ist)