第63回国民体育大会陸上競技・男子100mは、2008年10月3日に少年男子A、10月4日に少年男子Bが大分県の九州石油ドームで行われた。
大会前の主な記録は次の通り
通過条件:各組上位4着(Q)と各組5着以下の記録上位4名(q)風:
通過条件:各組上位2着(Q)と各組3着以下の記録上位2名(q)風:
風: