Il 5 marzo 2020 Bogdanovič e la sua ragazza Alexandra Vernigora, anche lei giocatrice di scacchi, furono trovati morti in un appartamento di Mosca, con al loro fianco dei palloncini riempiti con ossido di diazoto[1]. La polizia non ha trovato indizi di altri responsabili. Altre fonti hanno sostenuto che i due avevano delle borsine di plastica sopra la faccia[2]. Il fatto è accaduto pochi giorni dopo che Bogdanovič aveva giocato con una squadra russa contro una squadra ucraina.
Ottenne il suo massimo rating FIDE in settembre 2019, con 2616 punti Elo.