La Scottish Second Division 2012-2013 (denominata IRN-BRU Scottish Football League Second Division 2012-2013 per motivi di sponsorizzazione) è stata la 38ª edizione del torneo da quando rappresenta il terzo livello del campionato di calcio scozzese.
Il titolo è stato vinto dal Queen of the South Football Club che ha così ottenuto la promozione alla Scottish First Division 2013-2014[2].
Legenda:
Note:
Ai play-off partecipano la 2ª, 3ª e 4ª classificata della Second Division (Alloa Athletic, Brechin City, Forfar Athletic) e la 9ª classificata della Scottish First Division 2012-2013 (Dunfermline).
Ai play-out partecipano la 9ª classificata della Second Division (East Fife) e la 2ª, 3ª e 4ª classificata della Scottish Third Division 2012-2013 (Peterhead, Queen's Park e Berwick Rangers).
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