Inizia a giocare a pallone tra i professionisti con gli uruguaiani del Danubio, dove gioca per cinque stagioni collezionando 82 presenze e 11 reti. Viene acquistato, congiuntamente alla Lazio, dalla Juventus,[1] che nell'estate del 1991 lo gira quindi in comproprietà alla Cremonese, in Serie A, collezionando solo 13 presenze senza segnare gol; Pereira decide dunque di andare via dal calcio italiano per approdare al Boca Juniors.
Con gli argentini il centrocampista colleziona 16 presenze senza segnare reti ed a fine campionato viene ceduto al Nacional Montevideo dove restò un anno nell'estate del 1994 quando viene acquistato dal Peñarol, prima di concludere la sua carriera nella stagione 1998-1999 con l'Huracan.