L'edizione 2005-06 dell'Apertura vide la vittoria del Boca Juniors che riuscì ad avere la meglio sul Gimnasia de La Plata.
Anche la Clausura venne vinta dal Boca Juniors che divenne la prima squadra, oltre al River Plate nel 1999/2000, a vincere l'Apertura e la Clausura nella stessa stagione. Il Lanús fu la squadra rivelazione della Clausura chiudendo il torneo al 2º posto.
Dopo una stagione disastrosa, Instituto e Tiro Federal vennero retrocesse con largo anticipo in Primera B Nacional. La terzultima e la quartultima della classifica retrocessioni, Argentinos Juniors e Olimpo de Bahía Blanca, disputarono degli spareggi salvezza contro le cadette Huracán e Belgrano de Córdoba. Se l'Argentinos Juniors riuscì a salvarsi grazie a due pareggi con l'Huracan, l'Olimpo invece perse entrambe le partite con il Belgrano retrocedendo in Nacional B.
Torneo di Apertura
Classifica marcatori
Torneo di Clausura
Classifica marcatori
Retrocessioni
Argentinos Juniors rimane in Primera Division dopo un pareggio per 3 - 3 in virtù di un "vantaggio sportivo". Infatti in caso di un pareggio la squadra di Primera Division si salva.
Belgrano de Córdoba vince 4-2 e viene promossa in Primera Division. Club Olimpo viene retrocesso in Nacional B.
Serie minori