Ecco l'elenco in ordine alfabetico per province dei Musei della Sicilia. (Questa lista è suscettibile di variazioni e potrebbe essere incompleta o non aggiornata.)
Nel 1977 nella Regione Siciliana, in applicazione dello Statuto speciale, le competenze dei beni culturali sono passate dallo Stato alla regione. Così i tre musei nazionali di Palermo, Siracusa e Trapani sono divenuti regionali.

L'assessorato regionale ai Beni culturali e all'identità siciliana ha disciplinato più volte il settore. Nel 2016 ha istituito la rete dei Poli museali della Sicilia, gestiti dalla Regione^[1].

Nell'elenco sono indicati anche i musei comunali e quelli privati. In evidenza i comuni con almeno due musei segnalati.

• Museo archeologico regionale di Agrigento
• Antiquarium documentario
• Antiquarium iconografico
• Antiquarium delle fortificazioni
• Antiquarium paleocristiano e bizantino
• Musei civici agrigentini
• Museo della cattedrale
• Museo di paleontologia umana
• Museo di scienze naturali Empedocle
• Museo antichi strumenti di misurazione scientifica Foderà
• Museo antiche unità di misura
• Museo vivente del Mandorlo
• Museo medievale
• Museo del gioco
• Archivio storico
• Museo eredità immateriali
• Biblioteca museo Luigi Pirandello
• Museo del mare

• Casa museo Carmelo Cammarata, Bivona
• Antiquarium comunale Di Pisa e Guardì, Casteltermini
• Antiquarium di Eraclea Minoa, Cattolica Eraclea
• Museo archeologico della Badia, Licata
• Museo etnoantropologico di Ribera^[2], Ribera
• Museo etnoantropologico della Terra di Zabut, Sambuca di Sicilia
• Antiquarium di Monte Kronio - Stufe di San Calogero, Sciacca
• Casa-museo "F. Scaglione", Sciacca
• Giardino museo Castello incantato di Filippo Bentivegna, Sciacca
• Museo della ceramica Muceb, Burgio
• Museo civico Antonio Mendola, Favara

• Museo archeologico di Caltanissetta
• Museo diocesano di Caltanissetta
• Museo del folclore e delle tradizioni popolari di Caltanissetta
• Museo mineralogico e paleontologico della Zolfara
• Museo Michele Tripisciano

• Museo archeologico regionale di Gela, Gela
• Antiquarium iconografico di Capo Soprano, Gela
• Synvolum, casa del lago alato (Museo Naturalistico R. N. O. Lago Biviere).

• Museo archeologico regionale di Marianopoli, Marianopoli^[3][4]
• Museo civico di Butera
• Museo della civiltà contadina di Niscemi
• Museo mineralogico di Riesi
• Museo civico mineralogico di Sommatino
• Museo delle zolfare di Montedoro
• Museo etnoantropologico della civiltà contadina di San Cataldo^[5]
• Museo etnoantropologico della civiltà contadina di Sutera

• Casa museo Giovanni Verga
• Città della scienza di Catania
• Museo civico belliniano
• Museo civico di Castello Ursino
• Museo di paleontologia di Catania
• Museo di zoologia di Catania
• Museo Emilio Greco (Catania)
• Museo diocesano di Catania
• Museo arte contemporanea Sicilia
• Museo della sbarco in Sicilia

• Museo civico Gaetano Savasta
• Palazzo delle arti
• Galleria d'arte moderna
• Casa Museo del Cantastorie

• Museo archeologico regionale di Adrano, Adrano
• Museo civico di Aci Castello, Aci Castello
• Biblioteca e pinacoteca Zelantea, Acireale
• Museo del carretto siciliano "Gullotti", Bronte
• Museo di civiltà contadina di Bronte, Bronte
• Musei civici e pinacoteca "Luigi Sturzo", Caltagirone
• Museo regionale della ceramica di Caltagirone
• ^{[collegamento interrotto]}, Castel di Iudica
• Museo di San Nicolò, Militello in Val di Catania
• Tesoro di Santa Maria La Stella, Militello in Val di Catania
• Museo capuaniano, Mineo
• Ludum Museo della Scienza, Misterbianco
• Museo vulcanologico Etneo, Nicolosi
• Museo civico archeologico di Ramacca, Ramacca
• Museo civico archeologico Paolo Vagliasindi, Randazzo
• Museo civico di scienze naturali di Randazzo

• Museo Alessi
• Museo archeologico regionale di Enna

• Museo bellico "Belli Instrumentum", (ANC - Barrafranca)
• Museo archeologico di Aidone, Aidone (sito di Morgantina)
• Museo ferroviario di Villarosa, Villarosa
• Museo archeologico regionale di Centuripe, Centuripe
• Museo diocesano di Piazza Armerina, piazza Armerina
• Museo etnoantropologico e dell'emigrazione valguarnerese, Valguarnera Caropepe
• Museo antiquarium di Valguarnera Caropepe, Valguarnera Caropepe
• Casa museo Caripa, Valguarnera Caropepe

• Museo regionale di Messina, Messina
• Museo Annibale Maria di Francia, Messina
• Museo "Cultura e musica popolare dei Peloritani", Messina
• Tesoro del Duomo, Messina
• Galleria provinciale d'arte moderna e contemporanea, Messina
• Archivio - mostra permanente su Salvatore Quasimodo "La vita non è un sogno, Messina
• Mostra dei tesori della Cappella Palatina in San Giovanni di Malta, Messina
• Acquario comunale, Messina
• Museo zoologico "Cambria", Messina
• Orto botanico "Pietro Castelli", Messina
• Museo storico della fortificazione permanente dello Stretto di Messina, Messina
• Museo su minerali e animali, collegio S. Ignazio, Messina

• Museo civico della cultura delle arti figurative bizantine e normanne di San Marco d'Alunzio, presso ex monastero delle Benedettine detto "Badia piccola"
• Museo di arte sacra di San Marco d'Alunzio, presso la chiesa San Giuseppe"
• Museo etnoantropologico di San Marco d'Alunzio, presso il "Circolo Demenna"
• Museo basiliano di San Marco d'Alunzio, presso il "convento dei Frati minori dei cappuccini"

• MuMa - Museo del Mare Milazzo
• Antiquarium archeologico "Domenico Ryolo"
• Museo della tonnara
• Museo enologico "Grasso"

• Parco Museo Jalari
• Museo Etnostorico "Nello Cassata"

• Museo civico
• Pinacoteca di Santa Maria degli Angeli

• Museo regionale delle tradizioni silvo-pastorali Giuseppe Cocchiara, Mistretta
• Museo civico polivalente "Egidio Ortolani" di Mistretta, Mistretta
• Museo della fauna dei Nebrodi, Mistretta
• Museo diocesano, Mistretta
• Museo dello scalpellino, Mistretta

• Antiquarium comunale, Acquedolci
• Museo d'arte sacra presso il monastero delle Vergini benedettine, Alcara Li Fusi
• Museo civico delle ceramiche, Santo Stefano di Camastra
• Museo etnografico dei Nebrodi "Antonio Gullotti", Ucria
• Museo archeologico di Naxos, Giardini Naxos
• Antiquarium di Patti, Patti
• Raccolta di vasi da farmacia, Roccavaldina
• Museo siciliano delle tradizioni religiose, San Salvatore di Fitalia
• Museo etnoantropologico dei Nebrodi, Sant'Agata di Militello
• Museo diocesano di Santa Lucia del Mela, Santa Lucia del Mela
• Museo del mondo contadino di Savoca, Savoca
• Museo etnoantropologico di Scaletta Zanclea, Scaletta Zanclea
• Parco letterario Salvatore Quasimodo, Roccalumera
• Villa Piccolo, Capo d'Orlando
• Museo del mare della pesca e delle tradizioni marinare "Franco Ruggeri", Furci Siculo
• Museo del Bosco, Caronia

• Galleria d'arte "G. Sciortino", Monreale
• Museo diocesano, Monreale

• Museo civico di Castelbuono, Castelbuono
• Museo naturalistico Francesco Minà Palumbo, Castelbuono
• Museo del Risorgimento "I viaggi", Castelbuono

• Museo Mandralisca, Cefalù
• Civico museo antropologico di Balestrate, Balestrate
• Museo civico di Bisacquino, Bisacquino
• Casa museo di Bolognetta, Bolognetta
• Museo civico "Monsignor Filippo Meli", Ciminna
• Antiquarium comunale di Contessa Entellina, Contessa Entellina
• Museo civico comprensoriale "Pippo Rizzo", Corleone
• Museo civico di Gangi, Gangi
• Museo delle Madonie, Geraci Siculo
• Museo etno-antropologico "Godranopoli", Godrano
• Antiquarium di Partinico, Partinico
• Museo civico "A.Collisani", Petralia Sottana
• Museo del Centro di documentazione etnografica "U 'parmintieddu", Petralia Sottana
• Museo del territorio "F. R. Fazio", Roccapalumba
• Museo civico iatino, San Cipirello
• Antiquarium di Solunto, Santa Flavia
• Museo civico "B. Romano", Termini Imerese
• Museo regionale di Terrasini, Terrasini
• Museo della Targa Florio, Collesano

• Museo archeologico ibleo
• Parco Archeologico di Ragusa Ibla
• Museo archeologico regionale di Kamarina Kamarina
• Castello di Donnafugata
• Museo della cattedrale di San Giovanni
• Museo del duomo di San Giorgio
• Civica raccolta Carmelo Cappello
• Museo diocesano di Ragusa
• Museo naturale e delle miniere d'asfalto di Tabuna e Castelluccio
• Museo L'Italia in Africa
• Museo delle tradizioni popolari ragusane

• Museo dell'olio
• Museo di cimeli storico militari
• Pinacoteca Giovanni De Vita
• Museo del ricamo e dello sfilato siciliano
• Museo degli strumenti etnico musicali
• Museo ornitolgico
• Casa-museo liberty
• Museo di arte sacra

• Museo civico di storia naturale di Comiso^[6]
• Museo d'arte contemporanea "Euro Musso", Comiso

• Museo Civico "F. L. Belgiorno"
• Museo Ibleo delle Arti e Tradizioni Popolari "S. A. Guastella"
• Museo Cava D'Ispica

• Museo Polivalente
• Museo Storico Italo-Ungherese
• Museo d'arte Sacra Mons. Federico La China
• Museo della civiltà contadina (Vittoria)

• Antiquarium del Parco della Forza, Ispica
• Parco Archeologico di Kaukana

• Museo Archeologico Regionale Paolo Orsi
• Galleria regionale Palazzo Bellomo - Museo interdisciplinare
• Museo del Papiro
• Museo dei Pupi

• Museo dei Viaggiatori in Sicilia, Palazzolo Acreide
• Museo archeologico Gabriele Judica, Palazzolo Acreide
• Casa-museo "Antonino Uccello", Palazzolo Acreide
• Museo dell'informatica Funzionante, Palazzolo Acreide

• Ecomuseo "I luoghi del lavoro contadino e dell'artigianato", Buscemi
• Ecomuseo degli Iblei
  • Museo TEMPO, Canicattini Bagni
• Area archeologica e Antiquarium di Megara Hyblaea, Augusta
• Museo Archeologico, Lentini
• Museo Francesco Lombardo di Giuseppe, Floridia

• Museo Regionale Agostino Pepoli
  • Sezione Dipinti, sculture del Rinascimento
  • Sezione Marmi, lapidi, arti industriali
  • Sezione Risorgimento
• Museo civico Torre di Ligny
• DiArt, museo diocesano di arte contemporanea
• Museo del Sale di Nubia (TP)^[7].
• Museo diocesano Sant'Agostino
• Museo delle illusioni ottiche

• Museo Archeologico Regionale Lilibeo "Baglio Anselmi",
• Museo Archeologico "Giuseppe Whitaker", Mozia
• Museo degli Arazzi Fiamminghi Mons. Andrea Linares
• Museo civico di Marsala suddiviso in tre sezioni:
  • Sezione Archeologica;
  • Sezione Museo risorgimentale garibaldino Giacomo Giustolisi;
  • Sezione delle tradizioni popolari
• Museo del sale Ettore Infersa
• Ente Mostra di Pittura Contemporanea "Città di Marsala"
• Enomuseum
• Museo Mirabile delle tradizioni ed arti contadine di Marsala

• Museo diocesano di Mazara del Vallo
• Museo del Satiro danzante
• Museo ornitologico

• Museo d'arte contemporanea di Alcamo
• Museo etnografico degli strumenti musicali "Gaspare Cannone"
• Museo d'arte sacra

• Fondazione Orestiadi
• Museo civico d'arte contemporanea di Gibellina
• Museo etnoantropologico della Valle del Belice
• EpiCentro della Memoria Viva^[8]

• Museo Agro-Forestale "San Matteo"
• Museo Civico "A. Cordici"
• Salerniana di pittura

• Museo civico selinuntino
• Museo del Vino e delle Cantine Montalto

• Antiquarium Ex Stabilimento Florio delle Tonnare di Favignana e Formica
• Museo civico palazzo Florio

• Museo archeologico, presso il castello Barbacane
• Museo del mare "Sebastiano Tusa"^[9]
• Museo vulcanologico di Khaggiar ^[10]

• Museo della Preistoria Castello Grifeo, Partanna
• Museo della civiltà locale, Buseto Palizzolo
• Museo etnoantropologico, Calatafimi-Segesta
• Museo preistorico, Paceco
• Museo del Sale, Paceco
• Mostra di cimeli del Risorgimento, Salemi
• Museo civico, Salemi
• Museo del tonno e della tonnara, Bonagia
• Museo dell'artigianato "Molino Excelsior", Valderice

• Elisa Bonacini, La visibilit@ sul web del patrimonio culturale siciliano. Catania, Giuseppe Maimone Editore, 2012. ISBN 978-88-7751-342-7
• Giuseppe Puma, Enzo Minio, Giuseppe Pasciuta, Dalla semina al pane - Il museo etnoantropologico di Ribera (PDF), Prefazione di Andrea Camilleri, Regione Siciliana - Assessorato Agricoltura e Foreste, 2008. URL consultato il 16 novembre 2009 (archiviato dall'url originale il 16 giugno 2015). ISBN non esistente

• Poli museali della Sicilia

• Wikimedia Commons contiene immagini o altri file su musei della Sicilia

• La mappa dei Musei, Parchi e Aree Archeologiche Regionali in Sicilia, su google.com.
• Musei dei Nebrodi, su tirrenonebrodi.net. URL consultato il 29 aprile 2009 (archiviato dall'url originale il 28 aprile 2009).
• Museo Sicilia^{[collegamento interrotto]} Villa delle Meraviglie
• Audio guide gratuite iziTRAVEL - Musei in Sicilia, su izi.travel.

V · D · M Musei in Italia per regione
Piemonte • Valle d'Aosta • Lombardia • Trentino-Alto Adige • Veneto • Friuli-Venezia Giulia • Liguria • Emilia-Romagna • Toscana • Umbria • Marche • Lazio • Abruzzo • Molise • Campania • Puglia • Basilicata • Calabria • Sicilia • Sardegna
Musei nazionali italiani

V · D · M Musei della Sicilia
Agrigento	Antiquarium di Monte Kronio · Museo archeologico regionale di Agrigento · Museo archeologico della Badia · Casa museo Carmelo Cammarata · Museo diocesano (Agrigento) · Museo civico della città di Naro
Caltanissetta	Antiquarium iconografico · Museo archeologico regionale di Gela · Museo della civiltà contadina di Marianopoli · Museo diocesano di Caltanissetta · Museo mineralogico di Caltanissetta · Museo Tripisciano · Museo delle solfare di Trabia Tallarita · Museo regionale interdisciplinare di Caltanissetta
Catania	Antiquarium regionale del Teatro romano · Biblioteca e pinacoteca Zelantea · Casa museo Giovanni Verga · Città della scienza di Catania · Museo archeologico etneo · Museo civico al Castello di Aci · Museo civico al Castello Ursino · Museo Biscari · Museo civico archeologico Paolo Vagliasindi · Museo civico belliniano · Museo civico Gaetano Savasta · Museo del giocattolo · Musei civici Luigi Sturzo · Museo della ceramica (Caltagirone) · Museo diocesano · Museo di zoologia di Catania · Museo Emilio Greco (Catania) · Orto botanico di Catania · Museo dello sbarco in Sicilia · Museo di arte sacra (Misterbianco) · Museo di archeologia dell'Università di Catania · MacS · Museo paleontologico dell'Accademia Federiciana · Palazzo delle arti (Paternò)
Enna	Museo Alessi · Museo archeologico regionale di Enna · Museo archeologico di Aidone · Museo bellico Belli Instrumentum · Museo archeologico regionale di Centuripe · Museo Musical Art 3M
Messina	Antiquarium di Francavilla di Sicilia · Antiquarium Domenico Ryolo · Fiumara d'arte · Museo regionale di Messina · Museo etnostorico Nello Cassata · Museo archeologico regionale eoliano · Museo del bosco (Caronia) · Parco letterario Salvatore Quasimodo · Museo civico di Castroreale · Pinacoteca di Santa Maria degli Angeli · Villa Piccolo · Orto botanico Pietro Castelli · Casa Cuseni · Palazzo Corvaja
Palermo	Arsenale di Palermo - Museo del mare · Collezione storica degli strumenti di fisica · Galleria d'arte moderna di Palermo · Museo archeologico regionale Antonino Salinas · Museo Mormino e pinacoteca · Museo d'arte contemporanea della Sicilia · Museo d'arte islamica (Palermo) · Museo aptico di Sicilia · Museo civico di Castelbuono · Museo del costume Raffaele Piraino · Museo del giocattolo Pietro Piraino · Museo diocesano (Palermo) · Museum - Osservatorio dell'arte in Sicilia · Museo diocesano (Monreale) · Museo etnografico siciliano Giuseppe Pitrè · Museo Guttuso · Museo internazionale delle marionette · Museo Mandralisca · Museo Fra Giammaria da Tusa · Museo di paleontologia e geologia Gaetano Giorgio Gemmellaro · Museo della radiologia · Museo del Risorgimento · Museo storico dei motori e dei meccanismi · Museo di zoologia Pietro Doderlein · Orto botanico di Palermo · Palazzo Abatellis · Palazzo Branciforte · Palazzo Riso · Palazzo Ziino · Stanze al Genio · Museo regionale di Terrasini · Museo euromediterraneo delle arti contemporanee · Museo del Risorgimento (Castelbuono) · Museo civico Nicola Barbato · Museo della casa contadina
Ragusa	Museo archeologico ibleo · Museo archeologico regionale di Kamarina · Museo civico di storia naturale di Comiso
Siracusa	Ipogeo di piazza Duomo · Acquario tropicale di Siracusa · Museo archeologico regionale Paolo Orsi · Museo del mare · Museo del papiro · Museo di palazzo Bellomo · Museo aretuseo dei pupi · Museo archeologico Gabriele Judica · Museo dei viaggiatori in Sicilia · Casa Museo Antonino Uccello · Museo archeologico regionale di Lentini
Trapani	Museo regionale Agostino Pepoli · Museo archeologico Baglio Anselmi · Museo del Satiro danzante · Museo degli arazzi fiamminghi · Museo garibaldino di Marsala · Museo civico Torre di Ligny · Museo civico selinuntino · Museo d'arte contemporanea di Gibellina · Museo civico di Mazara del Vallo · Museo diocesano (Mazara del Vallo) · Museo ornitologico (Mazara del Vallo) · Mirabilia Urbis (Mazara del Vallo) · Salerniana · Tonnara di Favignana · Museo d'arte sacra di Alcamo · Museo diocesano di Trapani · Museo d'arte contemporanea San Rocco · Museo del sale (Nubia) · Museo Whitaker · Museo comunale Antonio Cordici · Museo d'arte contemporanea di Alcamo · Museo degli strumenti musicali multietnici Fausto Cannone · Museo delle Trame Mediterranee · Museo archeologico di Pantelleria