Studiò disegno con Louis Victor von Deschwanden, Johann Kaspar Moos (1825–1826) a Zugo, Daniel Albert Freudweiler e Johann Caspar Schinz a Zurigo (1827), quindi nel 1830 entrò nellꞌAccademia delle belle arti di Monaco di Baviera. Dopo essere stato a Losanna per imparare il francese (1835–1836), rientrò a casa.
Dopo un incontro con lꞌartista nazarenoFriedrich Overbeck, prese la decisione di dedicare le opere della propria vita alla pittura religiosa.
Tornato infine in Svizzera, ricevette la sua prima commessa da un ente religioso, la pala dꞌaltare della cappella di San Pietro a Lucerna.
Nel 1842 incontrò i membri della scuola per pittori di Düsseldorf e sꞌinteressò allꞌopera pittorica dellꞌartista austriacoEduard von Steinle, pittore religioso alla moda e nazareno.
Nel 1845 egli scoprì nella chiesa di San Luigi, a Monaco di Baviera, dei murali di Peter von Cornelius, un artista classico che era stato influenzato dal Movimento dei nazareni e visitò uno dei suoi allievi, il ritrattista e pittore storico Wilhelm von Kaulbach.
Sebbene fosse lui stesso un ritrattista di talento, dedicò la maggior parte del suo tempo ai dipinti con soggetto religioso, creando uno stile di composizioni di semplice comprensibilità, figure espressive e tecnica soffice.
Si ritiene che Deschwanden abbia dipinto oltre 2000 opere, il maggior numero delle quali sono pale di altare, e per quasi quarantꞌanni egli ha dominato la pittura religiosa in Svizzera. I suoi lavori furono ben accetti sia nei circoli cattolici che in quelli protestanti.
Di conseguenza, egli spedì le sue opere in tutto il mondo ed esempi possono essere trovati in chiese di Annapolis, del Maryland e Covington, del Kentucky. Le sue opere furono ampiamente riprodotte in pie riproduzioni cromolitografiche.
Allievi
Deschwanden è noto per aver avuto molti allievi, tra i quali vi erano artisti suoi colleghi da Stans Adalbert Baggenstos al pittore svizzero-americano Adolfo Müller-Ury, tra le cui braccia morì nel febbraio 1881.
Memoriale di Deschwanden
Nella parte frontale del giardino dellꞌex Nidwaldner Kantonalbank, nel centro di Stans, vi è un monumento dello scultore svizzero Auguste Stanser Blaesi, (1903–1979) che fu eretto in memoria di Deschwanden nellꞌautunno del 1933.