Nel 1998, dopo lo scioglimento dei Soundgarden, entra a far parte dei Pearl Jam in sostituzione di Jack Irons, esordendo nell'album live Live on Two Legs. Nel gruppo riveste occasionalmente anche il ruolo di autore di musiche e testi.
Parallelamente, da allora, suona anche nei Wellwater Conspiracy, progetto tuttora in attività.
Nel 2010 partecipa alla reunion dei Soundgarden, coi quali, nel 2011, pubblica l'album live Live on I-5, le cui registrazioni sono state effettuate nel 1996 durante il tour promozionale di Down on the upside, ultimo disco di inediti della band. L'anno successivo, 2012, con i Soundgarden pubblica King Animal, primo album di inediti dopo 16 anni di pausa e intraprende il relativo tour mondiale.