Nacque a Bruxelles come figlia di Joost van der Eycken, signore di Nederloo e governatore della città di Breda, e Barbara de Mol, figlia di Martin de Mol, Gran Falconiere del Re di Spagna nei Paesi Bassi spagnoli.
Il 13 marzo 1591 sposò a Bruxelles il conte Edoardo Fortunato di Baden-Baden. Poiché non era un membro dell'alta nobiltà, non era considerata una moglie adatta per un conte di mercato e i loro figli non furono mai come membri della famiglia dal cugino Margravio Ernesto Federico di Baden-Durlach. Tuttavia, il loro figlio Guglielmo avrebbe ereditato il titolo di conte di Baden-Baden.
Maria ed Edoardo Fortunato ebbero i seguenti figli: