Confluiscono nel lago circa 20 affluenti, emissario è il fiume Niva. Il lago è diviso da stretti canali in tre parti principali: Bol'šaja Imandra (la parte settentrionale del lago, di 328 km², misura circa 55 km, per 3-5 km), Ėkostrovskaja Imandra (parte meridionale, 351 km²) e Babinskaja Imandra (parte sud-occidentale, 133 km²). Sul lago sono presenti più di 140 isole.
Il lago è soggetto alla pressione antropica di varie imprese metallurgiche e minerarie a Olenegorsk, Mončegorsk, Kirovsk e Apatity. La baia di Moločnaja (nella Babinskaja Imandra) non gela tutto l'anno a causa dello scarico di acqua calda attraverso il canale dalla centrale nucleare di Kola. Questa baia è sede di allevamento di preziose specie ittiche, nonché un luogo popolare per la ricreazione dei residenti delle città vicine.
