Pratica lo slittino dall'età di 9 anni[1] e nel 1999 ha iniziato a competere per la nazionale slovacca nelle varie categorie giovanili sia nella specialità del singolo che in quella del doppio gareggiando in coppia con Adam Cech, con il quale giunsero terzi nella classifica generale della Coppa del Mondo juniores 2000/01. Partecipò inoltre a varie edizioni dei campionati mondiali juniores in entrambe le discipline, senza però ottenere risultati di particolare rilievo.
Specializzatosi nella disciplina individuale, Ninis esordì in Coppa del Mondo nel 2000/01, terminando l'annata al 32º posto in classifica generale. Ottenne il suo primo podio nell'ultima gara della stagione 2017/18, il 28 gennaio 2018 a Sigulda, dove concluse la gara del singolo sprint al secondo posto. In classifica generale come miglior risultato si è piazzato al 14º posto nel singolo nel 2017/18.
Agli europei vanta quali migliori risultati la sesta piazza nel singolo, ottenuta a Sigulda 2018, e la quinta a squadre, raggiunta nell'edizione di Soči 2012.
Palmarès
Coppa del Mondo
Miglior piazzamento in classifica generale di Coppa del Mondo nel singolo: 11º nel 2022/23.
1 podio (nel singolo sprint):
1 secondo posto.
Coppa del Mondo juniores
Miglior piazzamento in classifica di Coppa del Mondo juniores nel doppio: 3º nel 2000/01.
Note
^ab(EN) Athlete Profile - Jozef Ninis, su www.pyeongchang2018.com, Pyeongchang 2018 Olympic Organizing Committee for the 2018 Winter Olympics, 10 febbraio 2018. URL consultato il 10 febbraio 2018 (archiviato dall'url originale il 3 febbraio 2018).