Il Grote Prijs Stad Zottegem 1979, quarantaquattresima edizione della corsa, si svolse il 21 agosto 1979 su un percorso con partenza e arrivo a Zottegem. Fu vinto dal belga Pol Verschuere della Flandria-Ca va Seul-Sunair davanti ai suoi connazionali Eric Van de Wiele e Herman Van Springel.