Prese parte alla Guerra Franco-Prussiana dal 1870 al 1871 per poi esercitare medicina nel dipartimento di malattie neurologiche all'Ospedale della Carità di Berlino dal 1873 al 1875 dove si fece conoscere al pubblico per le sue capacità come medico. Nel 1877 incominciò a lavorare come professore privato di medicina, per poi passare ad esercitare come professore pubblico nel 1893.
Ernst Remak è stato lo scopritore del "Riflesso di Remak", un riflesso nervoso plantare delle prime tre dita dei piedi indotto dallo strozzamento del flusso sanguigno della coscia antero-superiore.