Nella VII legislatura del Parlamento Europeo è stata membro della Conferenza dei presidenti; della Commissione per il commercio internazionale; della Commissione per i diritti della donna e l'uguaglianza di genere; della Commissione per l'ambiente, la sanità pubblica e la sicurezza alimentare; della Delegazione alle commissioni di cooperazione parlamentare UE-Kazakistan, UE-Kirghizistan e UE-Uzbekistan e per le relazioni con il Tagikistan, il Turkmenistan e la Mongolia; della Delegazione all'Assemblea parlamentare Euromediterranea; della Delegazione all'Assemblea parlamentare paritetica ACP-UE.
Il 15 ottobre 2012 Muscardini lascia Futuro e Libertà e presenta a Milano, insieme a Martin Callanan e a Geoffrey Clifton-Brown, il nuovo movimento Conservatori e Social Riformatori che aderisce in Europa al Gruppo dei Conservatori e dei Riformisti Europei (ECR).[2][3]