La Coppa Italia di Serie B 1999-2000 è stata la 2ª edizione della Coppa Italia di categoria, a cui erano iscritte di ufficio tutte le società di Serie B. La formula della competizione prevede una prima fase, articolata in incontri di andata e ritorno, e una fase finale in gara unica, entrambe a eliminazione diretta. La fase finale, organizzata dalla società Perugia Calcio a 5, si è tenuta il 17 e 18 marzo 2000 presso il PalaEvangelisti di Perugia. Risulta qualificata al turno successivo la squadra che nelle due partite ha ottenuto il miglior punteggio, ovvero, a parità di punteggio, la squadra che ha realizzato il maggior numero di reti. Qualora sussistesse la condizione di parità, si disputeranno due tempi supplementari ed eventualmente i tiri di rigore per determinare la vincitrice
La final four della Coppa Italia di categoria è stata organizzata dalla società Perugia Calcio a 5 e si è svolta il 17 e il 18 marzo 2000 presso il PalaEvangelisti di Perugia[1].