Fra il 1534 e il 1564 il suo laboratorio produsse almeno 71 atlanti di cartine nautiche, di minor valore rispetto alle carte della Scuola Cartografica di Dieppe, ma considerate di fine artigianato. Le carte solitamente includevano la latitudine, ma non la longitudine, ed erano profusamente decorate.
Uno dei lavori più conosciuti di Agnese è un atlante commissionato da Carlo V per suo figlio Filippo II. Apparentemente prodotto intorno al 1542, rappresenta correttamente la baia della California come una penisola e non come un'isola.
Ad Agnese piaceva inserire le nuove scoperte geografiche nelle sue carte. Per esempio, egli tracciò nel suo planisfero la rotta del viaggio di Ferdinando Magellano, e in oro puro la rotta dalla Spagna al Perù attraverso l'Istmo di Panama, che serviva per trasportare l'oro dalle colonie alla madrepatria.
Bibliografia
Levenson, Jay A. Circa 1492: Art in the Age of Exploration. Washington: National Gallery of Art, 1993.
Short, John Rennie. The World Through Maps: A History of Cartography. Toronto: Firefly Books, 2003.
Library of Congress: Agnese Atlas. Portolan atlas of 9 charts and a world map, etc. Dedicated to Hieronymus Ruffault, Abbot of St. Vaast. (1544)