Questa voce raccoglie le informazioni riguardanti la Società Sportiva Juve Stabia nelle competizioni ufficiali della stagione 1999-2000.
Stagione
Nella stagione 1999-2000 la Juve Stabia è giunta al quattordicesimo posto nel campionato di Serie C1 girone B e, perdendo i play-out contro l'Atletico Catania, retrocede in Serie C2.