I genitori sono di origine olandese e si sono trasferiti a Sabadell, in Spagna nel 1978. Il padre Paulus è stato allenatore di nuoto del CN Sabadell in Spagna. Anche la madre è stata allenatrice di nuoto. Suo fratello Olaf Wildeboer ha rappresentato la Spagna ai Giochi olimpici di Atene 2004 e in seguito, dal 2016, ha gareggiato per i Paesi Bassi. Olaf Wildeboer è poi divenuto allenatore dell'Hovedstadens Svommeklub di Copenaghen, in Danimarca.
Aschwin Wildeboer ha iniziato a nuotare sin da piccolo. Si è specializzato nel dorso, ha partecipato alle Olimpiadi di Pechino 2008 in rappresentanza della Spagna giungendo settimo nella specialità dei 100 metri dorso.