Nel 1953 fu insignito dalla Columbia University del prestigioso premio Maria Moors Cabot. Negli anni seguenti il suo giornale, pur acquisendo notorietà e fama nell'intera America Latina, fu perseguitato dal regime dittatoriale di Alfredo Stroessner. Nonostante le minacce e le intimidazioni, Schaerer continuò a criticare il governo paraguaiano dalle colonne de La Tribuna.
Rimase alla direzione de La Tribuna sino al 15 maggio 1972 quando fu succeduto dal genero Carlos Ruiz Apezteguia.