Fece i primi passi della propria carriera sotto l'apprendistato di Johannes de Haan, il quale gli insegnò i rudimenti delle incisioni; dopo due anni studiò arte con Willem van Drielenburch, con il quale passò l'anno disastroso del 1672. Studiò poi nove mesi con Jacob Levecq e successivamente con Samuel van Hoogstraten. Nel 1685 sposò Sara Sasbout, e attorno al 1709 si trasferì ad Amsterdam, dove poi morì.
Ebbe dieci figli, tra i quali ricordare Jacobus Houbraken, incisore che si occupò di ritratti e illustrazioni per libri (tra i quali quelli del padre). La figlia Antonina Houbraken divenne anch'essa un'artista, nota per le sue incisioni con vedute di città ed edifici con persone e animali.
Opere
Inhoud van 't Sieraad der Afbeelding (1712)
Aen den heere Jakob Zeeus, den Wolf in 't schaepsvel ter drukpersse bestellende (1711)
De groote schouburgh der Nederlantsche konstschilders en schilderessen (1718)
