Antônio Francisco Braga è nato a Rio de Janeiro e ha studiato con Luiz António de Moura e Carlos de Mesquita. Nel 1886 fondò la Sociedade de Concertos Populares. Quando la Repubblica Brasiliana fu dichiarata nel 1889, la sua composizione Hino à bandeira fu adottata come inno nazionale brasiliano. A partire dal 1890 Antônio Francisco Braga studiò al Conservatorio di Parigi con Jules Massenet. Dopodiché trascorse del tempo sia in Germania che in Italia e poi tornò in Brasile nel 1900. Al suo ritorno in Brasile, Antônio Francisco Braga insegnò all'Instituto Nacional de Música e fu direttore della Sociedade de Concertos Sinfonicos tra il 1908 e il 1933. Uno dei suoi allievi fu la pianista e compositrice brasiliana Cacilda Borges Barbosa.
Braga ha composto tre opere e ha prodotto brani per orchestra, musica da camera, brani per pianoforte e molte canzoni.