Il fiume scorre generalmente verso sud, attraversando nel New Hampshire Errol, Milan e Berlin prima di girare verso est, passando Gorham e le White Mountains ed entrando nel Maine, dove scorre in Bethel, Rumford e Dixfield prima di girare di nuovo verso sud presso Livermore Falls. Il fiume attraversa poi Lewinston e Auburn, raggiungendo il livello del mare poco prima di Brunswick. La Merrymeeting Bay è un estuario di acqua dolce, lungo 16 km, in cui l'Androscoggin incontra il Kennebec e altri quattro fiumi.
Qualità dell'acqua
L'Androscoggin un tempo era inquinato dai residui di diverse industrie che erano situate sulle sue sponde, tra cui alcune cartiere, e questo inquinamento fu una delle ispirazioni per il Clean Water Act.[2][3] Sebbene la qualità dell'acqua si migliorata negli anni seguenti, l'inquinamento è ancora presente, specialmente nella parte inferiore del fiume.[3]
Portata
Vi sono quattro stazioni di rilevamento lungo l'Androscoggin, tutte a valle di una o più dighe:
Errol (44°46′57″N 71°07′46″W44°46′57″N, 71°07′46″W), a valle di 2710 km2 di bacino: qui la portata media (tra il 1905 e il 2005) è di 54,3 m3/s;
Gorham (44°26′10″N 71°11′27″W44°26′10″N, 71°11′27″W), a valle di 3520 km2 di bacino: qui la portata media (tra il 1905 e il 2005) è di 71 m3/s;
Rumford (44°33′04″N 70°32′38″W44°33′04″N, 70°32′38″W) a valle di 5360 km2 di bacino: qui la portata media (tra il 1905 e il 2005) è di 107,6 m3/s;