Il campionato è composto di 14 squadre, che disputano un girone all'italiana con partite di andata e ritorno, per un totale di 26 giornate. Al campionato possono accedere anche le formazioni riserva delle squadre di Frauen-Bundesliga. Le prime due classificate vengono promosse in Frauen-Bundesliga; se tra le prime due vi è una formazione riserva, allora viene promossa a scalare la squadra successiva non riserva. Le ultime tre classificate vengono retrocesse in Frauen-Regionalliga.
Fino alla stagione 2017-2018 la formula del campionato constava di due gironi all'italiana da dodici squadre ciascuno, girone Nord e girone Süd, al quale potevano accedere anche le formazioni riserva delle squadre femminili titolari. Le rispettive vincitrici dei due gironi accedevano alla Frauen-Bundesliga a meno di essere una squadra riserve, in quel caso veniva promossa la prima squadra titolare presente in classifica, mentre le ultime due classificate venivano retrocesse in Frauen-Regionalliga.
^Il Bayern Monaco II non è stato promosso in Frauen-Bundesliga perché squadra riserva.
^La stagione 2019-2020 di 2. Frauen-Bundesliga è stata definitivamente sospesa il 25 maggio 2020 a causa della pandemia di COVID-19 in Germania. La classifica alla sedicesima giornata è stata considerata quella finale e le prime due squadre eleggibili sono state promosse. Cfr. (DE) Saisonabbruch in 2. Frauen- und B-Juniorinnen-Bundesliga, su dfb.de, 25 maggio 2020. URL consultato il 15 giugno 2020.
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