Existas du posibla origini por la nomo Ubatuba, ambe rezultinta de la junturo di vorti de la linguo Tupi: tyba signifikas "grupo" en Tupi; kontre ke ubá signifikas "kanoo", ed u'ubá esas la nomo por certena speco di junko multe rezistanta, uzita dal indijeni por manufakturar flechi. Do, Ubatuba posible originis sive de ubá+tyba ("grupo di kanoi"), sive de u'ubá+tyba ("grupo di junki").