Sungai Dondang bermuara pada Delta Sungai Mahakam tepatnya berada di daerah Kecamatan Muara Jawa . Sungai Dondang merupakan pertemuan anak anak sungai. Hulu Sungai Dondang merupakan Sungai Bambangan yang berasal dari Perbukitan Ulu Sakakanan di wilayah timur Kelurahan Bukit Merdeka.
Anak sungai
Anak sungainya diantaranya adalah Sungai Tiram, Sungai Galendrong, Sungai Pelabu, Sungai Kamboja, Sungai Nyamuk, Sungai Panani dan Sungai Banaka.