Selat Lewotobi adalah selat yang memisahkan antara Pulau Flores dengan pulau kecil di sebelah selatan Pulau Solor. Secara administratif, selat ini termasuk dalam wilayah Kabupaten Flores Timur. Sisi selatan kota Larantuka di ujung Pulau Flores berbatasan dengan Selat Gonzalez, selat yang memisahkan Pulau Flores di sisi barat dengan Pulau Adonara di timur. Selat Gonzalez sering disebut dengan bahasa lokal yaitu selat Gonzalo.
