Rev (HIV)

Protein REV terikat pada RRE mRNA
Ditunjukkan di atas adalah kompleks RNP yang dibentuk oleh HIV-1 REV yang mengikat RRE pada mRNA gen env. Yang disorot dalam slate adalah ARM dari domain pengikatan RNA, sedangkan yang berwarna hijau adalah mRNA dengan struktur seperti loop batang sekunder (PDB 4PMI).
Identifikasi
SimbolREV
PfamPF00424
InterProIPR000625
SCOP484d
SUPERFAMILY484d

Rev adalah sebuah protein transaktivasi yang penting untuk regulasi ekspresi protein HIV-1 (dan lentiviral lainnya). Sinyal lokalisasi nuklir dikodekan dalam gen rev, yang memungkinkan protein Rev dilokalisasi ke nukleus, di mana ia terlibat dalam ekspor mRNA yang tidak disambung dan tidak disambung tidak lengkap. Dengan tidak adanya Rev, mRNA dari gen akhir (struktural) HIV-1 dipertahankan dalam nukleus.

Sejarah

Sebuah protein baru ditemukan terlibat dalam terjemahan gag dan env mRNA. Protein yang tidak diketahui berfungsi dengan menghilangkan represi dari urutan pengaturan dan diberi nama Art (transaktivator anti-represi).[1] Studi selanjutnya menunjukkan bahwa protein terlibat dalam regulasi mekanisme penyambungan RNA. Oleh karena itu, nama protein diubah dari Art menjadi Trs (transregulator splicing).[2] Penelitian terbaru menunjukkan bahwa protein memiliki banyak fungsi dalam regulasi protein HIV-1, dan namanya telah diubah menjadi Rev (pengatur ekspresi protein virion), yang secara lebih umum menggambarkan fungsinya.[3]

Struktur

Rev adalah protein 13-k Da[4] yang terdiri dari 116 asam amino.[5] Urutan Rev berisi dua domain spesifik yang berkontribusi pada impor dan ekspor nuklirnya.

Motif kaya arginin

Wilayah N-terminal Rev berisi urutan kaya arginin. Motif kaya arginin (ARM) terletak di antara asam amino 38-49 dari gen rev[6] dan membentuk struktur sekunder alfa-heliks.[7] ARM adalah urutan yang sangat spesifik yang memungkinkan multimerisasi protein Rev, sebelum pengikatan RNA. Substitusi basa tunggal mengubah kemampuan Rev untuk membentuk tetramer.[8] Domain Rev yang kaya arginin berinteraksi dengan elemen rev-binding (RBE), yang merupakan bagian dari elemen respons HIV Rev (RRE) yang terletak di hilir intron gen env.[9] Struktur sekunder alfa-heliks secara khusus dapat dianggap sebagai motif helix-loop-helix, yang memungkinkan protein REV untuk mengikat secara stabil ke RRE RNA untuk membentuk kompleks ribonukleoprotein.[10] Domain juga berisi sinyal lokalisasi nuklir.[11]

Domain aktivasi rev (Sinyal ekspor nuklir)

Sinyal ekspor nuklir Rev terletak di residu 71-82[12] dari wilayah terminalus-C[13] dan kaya akan leusin.

Referensi

  1. ^ Sodroski J, Goh WC, Rosen C, Dayton A, Terwilliger E, Haseltine W (May 1986). "A second post-transcriptional trans-activator gene required for HTLV-III replication". Nature. 321 (6068): 412–7. Bibcode:1986Natur.321..412S. doi:10.1038/321412a0. PMID 3012355. 
  2. ^ Feinberg MB, Jarrett RF, Aldovini A, Gallo RC, Wong-Staal F (September 1986). "HTLV-III expression and production involve complex regulation at the levels of splicing and translation of viral RNA". Cell. 46 (6): 807–17. doi:10.1016/0092-8674(86)90062-0. PMID 3638988. 
  3. ^ Gallo R, Wong-Staal F, Montagnier L, Haseltine WA, Yoshida M (June 1988). "HIV/HTLV gene nomenclature". Nature. 333 (6173): 504. Bibcode:1988Natur.333..504G. doi:10.1038/333504a0 alt=Dapat diakses gratis. PMID 2836736. 
  4. ^ Cochrane A, Kramer R, Ruben S, Levine J, Rosen CA (July 1989). "The human immunodeficiency virus rev protein is a nuclear phosphoprotein". Virology. 171 (1): 264–6. doi:10.1016/0042-6822(89)90535-7. PMID 2741343. 
  5. ^ Kjems J, Calnan BJ, Frankel AD, Sharp PA (March 1992). "Specific binding of a basic peptide from HIV-1 Rev". The EMBO Journal. 11 (3): 1119–29. doi:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05152.x. PMC 556554 alt=Dapat diakses gratis. PMID 1547776. 
  6. ^ Hope TJ (May 1999). "The ins and outs of HIV Rev". Archives of Biochemistry and Biophysics. 365 (2): 186–91. doi:10.1006/abbi.1999.1207. PMID 10328811. 
  7. ^ Zapp ML, Hope TJ, Parslow TG, Green MR (September 1991). "Oligomerization and RNA binding domains of the type 1 human immunodeficiency virus Rev protein: a dual function for an arginine-rich binding motif". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 88 (17): 7734–8. Bibcode:1991PNAS...88.7734Z. doi:10.1073/pnas.88.17.7734 alt=Dapat diakses gratis. PMC 52377 alt=Dapat diakses gratis. PMID 1715576. 
  8. ^ Surendran R, Herman P, Cheng Z, Daly TJ, Ching Lee J (March 2004). "HIV Rev self-assembly is linked to a molten-globule to compact structural transition". Biophysical Chemistry. 108 (1–3): 101–19. doi:10.1016/j.bpc.2003.10.013. PMID 15043924. 
  9. ^ Auer, Manfred; Gremlich, Hans Ulrich; Seifert, Jan Marcus; Daly, Thomas J.; Parslow, Tristram G.; Casari, Georg; Gstach, Hubert (1994-03-15). "Helix-Loop-Helix Motif in HIV-1 Rev". Biochemistry (dalam bahasa Inggris). 33 (10): 2988–2996. doi:10.1021/bi00176a031. ISSN 0006-2960. PMID 7510518. 
  10. ^ Izaurralde E, Adam S (April 1998). "Transport of macromolecules between the nucleus and the cytoplasm". RNA. 4 (4): 351–64. PMC 1369623 alt=Dapat diakses gratis. PMID 9630243. 
  11. ^ Malim MH, McCarn DF, Tiley LS, Cullen BR (August 1991). "Mutational definition of the human immunodeficiency virus type 1 Rev activation domain". Journal of Virology. 65 (8): 4248–54. doi:10.1128/JVI.65.8.4248-4254.1991. PMC 248862 alt=Dapat diakses gratis. PMID 2072452. 
  12. ^ Meyer BE, Meinkoth JL, Malim MH (April 1996). "Nuclear transport of human immunodeficiency virus type 1, visna virus, and equine infectious anemia virus Rev proteins: identification of a family of transferable nuclear export signals". Journal of Virology. 70 (4): 2350–9. doi:10.1128/JVI.70.4.2350-2359.1996. PMC 190077 alt=Dapat diakses gratis. PMID 8642662. 
  13. ^ Fornerod M, Ohno M, Yoshida M, Mattaj IW (September 1997). "CRM1 is an export receptor for leucine-rich nuclear export signals". Cell. 90 (6): 1051–60. doi:10.1016/s0092-8674(00)80371-2 alt=Dapat diakses gratis. PMID 9323133.