Divisi animasi Nickelodeon dimulai dengan pembuatan tiga program animasi orisinal pada tahun 1991, Doug, Rugrats dan The Ren & Stimpy Show. Setelah perselisihan dengan pencipta Ren & StimpyJohn Kricfalusi pada tahun 1992, Nickelodeon mendirikan Games Animation untuk memproduksi usaha animasi di masa depan, termasuk serial pertama mereka yang berjudul Rocko's Modern Life. Games memproduksi sebagian besar serial animasi pada pertengahan tahun 1990-an untuk jaringan tersebut, bermitra dengan perusahaan terkenal seperti Frederator Studios. Pada tahun 1998, studio tersebut pindah dari Studio City, California ke Burbank untuk merayakan sebuah fasilitas baru, dan kemudian berganti nama menjadi Nickelodeon Animation Studio.
Selain Nickelodeon dan saluran saudaranya, studio ini juga memproduksi serial kartun untuk jaringan milik Viacom lainnya termasuk Paramount Network.