1 A profi egyesületekben játszott mérkőzések és gólok csak a bajnoki mérkőzések adatait tartalmazzák. 2 Utolsó elszámolt válogatott mérkőzés dátuma: 2020. május 28. * Mérkőzések (gólok száma)
Stine Jørgensen 16 évesen igazolt az Aalborg DH-hoz, amelynek a kezdetekben az utánpótlás csapataiban játszott. A dán bajnokságban 2008-tól kapott lehetőséget, a Bajnokok ligájában 2009-ben játszott először.[2] 2013-ban az FC Midtjylland Håndbold-hoz írt alá egy hároméves szerződést. Ezzel a csapattal megnyerte a dán bajnokságot, a dán kupát, és 2015-ben a Kupagyőztesek Európa-kupáját. 2016-ban ezüstérmes lett a bajnokságban. 2017-ben Jørgensen volt csapata legeredményesebb játékosa a bajnokságban, 21 mérkőzésen 132 gólt szerzett, a góllövőlista harmadik helyén végzett, csapatával pedig bronzérmes lett.[3] A Bajnokok ligájában is ez volt a leggólerősebb szezonja, 81 találatot ért el, ezzel a góllövőlista kilencedik helyezettje lett. 2017 őszétől az előző bajnokságban hatodik helyezett Odense Håndbold játékosa.