Bönig hatéves korában az Eintracht Freising csapatában kezdett futballozni, ahol első edzője az édesapja volt.[1] Sportkedvelő családból származik, ugyanis öccsei is labdarúgók: Sebastian német másodosztályú csapatoknál, míg Vincent az osztrák WAF Brigittenau-nál középpályás. Fiatalon, fivéreihez hasonlóan a Bayern München ificsapataiban is játszott. Ebben az időben 20 alkalommal az ifjúsági válogatottba is meghívót kapott. 2001 nyarán a Bayern második csapatától az MSV Duisburg-hoz szerződött, mellyel a német másodosztályban szerepelt. 2003-tól a VfL Bochum hátvédje lett.
A VfL színeiben az UEFA-kupában is szerepelt, jó teljesítményének köszönhetően pedig háromszor is bekerült a Team 2006-ba, a német B-válogatottba. Miután csapata 2005 nyarán búcsúzott a Bundesligától a 2005-2006-os idényben jelentős szerepe volt Bochum feljutásában. A 2007-es bennmaradás kivívásakor 2010-ig szerződést hosszabbítottak vele, Thomas Zdebel 2009 januárjában történt távozása után ő lett a csapat rangidős játékosa. 2012 nyarán elhagyta a VfL-t, mivel a klub nem hosszabbított szerződést vele.[2]
Pályafutása során szinte kizárólag csak bal oldali védőként szerepelt. A védelemben harcosságával, bevállalósságával vált a bochumi közönség kedvencévé. A 2008-2009-es évadban alkalmanként középpályásként is bevetették. Profi pályafutása során szerzett négy gólját a másodosztályú MSV Duisburg, illetve a Ferencváros színeiben szerezte.
Civilben hallókészülék-hangmérnöki képesítéssel rendelkezik, nős, két gyermeke van.[4]
2018 nyarán a német ötödosztályú BFC Wolfratshausen edzője lett.[5]