1 A profi egyesületekben játszott mérkőzések és gólok csak a bajnoki mérkőzések adatait tartalmazzák. 2 Utolsó elszámolt válogatott mérkőzés dátuma: 2015. augusztus 24. * Mérkőzések (gólok száma)
Pavel Horák szülővárosának csapatában, a HC Přerovban kezdett kézilabdázni. 1996-ban a Baník Karvinához igazolt, ahol 2001-ben mutatkozott be a bajnokságban. 2001-ben, 2002-ben, 2004-ben, 2005-ben és 2006-ban bajnoki címet nyert az együttessel, emellett 2001-ben és 2002-ben a kupagyőzelmet is megszerezte csapatával. 2006-ban a német másodosztályban szereplő Ahlener SG szerződtette, de egy évvel később már a Bundesligában szereplő Frisch Auf Göppingen játékosa volt. 2011-ben és 2012-ben EHF-kupát nyert a Göppingennel, ahol hat szezont töltött el összesen
A 2013-2014-es idény előtt a Füchse Berlin játékosa lett.[3] 2015-ben a fővárosi csapattal is EHF-kupát nyert, 2016 nyarán pedig a másodosztályú HC Erlangenben folytatta pályafutását.[4] 2017-ben a fehérorosz Meskov Breszthez igazolt.[5]