Majnek Antalt, a nagyszőlősi ferences misszió vezetőjét 1995. december 9-én nevezte ki segédpüspökké II. János Pál pápa, majd 1997-től ő lett az apostoli adminisztrátor. Az ő feladata lett az egyházszervezet felépítése.[2]2001-ben még mindig csak papja volt az egyházmegyének, rajtuk kívül missziós papok (változó személyi állománnyal, egyszerre akár hat országból) és szerzetespapok szolgáltak Kárpátalján. Eddigre az összes, még álló templomot, valamint 17 plébániaépületet és 13 egyéb egyházi épületet kapott vissza az egyházmegye. Az alapítást követő első nyolc évben 19 új templomot építettek, létrehoztak karitatív szervezeteket, valamint 11 szerzetesház jött létre.[3]
2022. január 28-án Ferenc pápa elfogadta Majnek Antal püspök lemondását az egyházmegye kormányzásáról és sede vacante apostoli kormányzóvá nevezte ki Lucsok Péter Miklós segédpüspököt.
munkácsi római katolikus segédpüspök: 2019. november 11.
sede vacante apostoli kormányzó: 2022. január 28. -
Korábbi püspökök
Antonio Franco kijevi apostoli nuncius, apostoli adminisztrátor (1993–1997)
Majnek Antal OFM apostoli adminisztrátor (1997–2002), megyés püspök (2002–2022)[1]
Egyházközségek
Az egyházmegye területén 97 plébánia[1] és 100 misézőhely található.[2]
Kárpátalján 2016 elején 20 egyházmegyés és 20 missziós pap szolgál. Hét kispap készül a hivatására, közülük négy ukrán anyanyelvű. Munkácson (korábban Nagyszőlősön) hároméves hitoktatói képzés működik.[2]
↑Megyéspüspök (magyar nyelven). Munkácsi római katolikus egyházmegye, 2016. [2014. szeptember 6-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2016. június 27.)