Di Donato Bourg-en-Bresse-ben született. Tizenkétéves korában apja bálzenekarában kezdett játszani. Felfedezte magának a szaxofont, majd a klarinétot, amely végül kedvenc hangszere lett.
Több együttes vezetője is volt, köztük a „Trio de clarinettes”, „Jacques Di Donato Quintet”, a „Mhère Quartet”, a „Système Friche” és a „Brahmâ”.
Létrehozta és irányította a „Fruits de” fesztivált. Jean-Louis Chautempsszel tagja volt egy szaxofon-kvartettnek. 1998-ban alt-klarinétot tervezett a Henri Selmer Paris hangszerkészítő cég számára.
Albumok
1982: Mad Sax II, „Quatuor de saxophones”
1991: Trio de clarinettes Live, Jacques Di Donato, Louis Sclavis, Armand Angster
1993: Clic!!!, Jacques Di Donato Quintet
1993: Green dolphy suite, Double trio
1995: Déblocage d'émergence, quartet
1996: Le Système Friche, Xavier Charles, Jacques Di Donato, In Situ