Haller I. István Bethlen Gábor valamint I. Rákóczi György bizalmas embere volt, 1629-től haláláig a fejedelmi tanács tagja. Előbb Küküllő vármegye főispánja, utóbb országos tábornok lett. Nagy befolyása volt abban, hogy Brandenburgi Katalint még férje életében fejedelemasszonnyá, annak lemondása után pedig, hogy Rákóczi Györgyöt fejedelemnek válasszák. 1637-1639 között az országgyűlés és a fejedelmi tábla elnöki tisztségét töltötte be Tholdalagi Mihállyal váltakozva. Fiúági birtokaira 1630-ban új adományt szerzett. Ő építtette a fejéregyházi és a zoltáni kúriákat. A katolicizmus védelmezője volt: 1643-ban újjáépítette a fehéregyházi rendházat, és ferenceseket telepített oda. Amikor a fejedelem 1648-ban a rendet betiltotta, és csak Csíksomlyón és Mikházán tűrte meg a szerzeteseket, Haller István vállalta, hogy az épületeket a szerzetesek visszatéréséig fenntartja.
