2001 és 2002 között az Szövetség ’90/Zöldek társelnöke volt. Mert 2002 megint megválasztották a Bundestagba és felvett a mandátumát, le kellett mondani a társelnökei tisztről.
A Szövetségi Delegált Konferencián (Bundesdelegiertenkonferenz) 2003. május 23-án úgy enyhülnek meg a hivatal és mandátum elválasztását, hogy Claudia Roth mint a Bundestag tagja 2004. október 2-án ismét szövetségi társelnökként futott. Megválasztották és 2013-ig maradt a hivatalban.
2013. október 22-én megválasztották a Bundestag alelnökének.