1999-ben alakult meg, az énekes Benjamin Burnley és a dobos Jeremy Hummel jóvoltából. Pennsylvaniában hamar híresek lettek. 1999-ben még az együttes neve Plan 9 volt, de 2000-re visszaváltoztatták Breaking Benjaminra. Burnley két barátja, Aaron Fink és Mark James otthagyta előző együttesét, a Lifert, és csatlakoztak a Breaking Benjaminhoz. A Breaking Benjamin logója egy kelta szimbólum, amit egy rajongó talált egy tetoválókönyvben.