Berger Ferenc posztókereskedő és Meisels Rozália fiaként született, izraelita családban. Nevét 1893-ban Benedekre magyarosította.[3] 1897. április 15-én Budapesten feleségül vette a váci születésű okrogi Zhuber Ilona Anna Olgát, akivel élete végéig házasságban éltek.[4]
Műegyetemi tanulmányait megszakítások és szakváltások jellemezték. A Magyar Királyi József Műegyetemen az 1887 és 1890 között beiratkozott mérnök szakos hallgató volt, az 1890-91. tanévben pedig kilépett hallgatóként tüntették fel az egyetemi évkönyvben. Ennek ellenére az 1891-92. tanévben is beiratkozott hallgató volt mindkét félévben, viszont a kilépési szándékot újból megjelölték. Az 1894-95. tanévben újra a mérnöki karon tanult, de csak egy szemesztert. 1904-ben tűnt újra fel a műegyetem évkönyvében a neve, ugyanis az 1904-1905-ös tanév mindkét félévében aktív hallgató volt, immár az építész karon. Építészi oklevelét végül 1905-ben szerezte meg.
Már diplomája megszerzése előtt, 1898-tól dolgozott építési vállalkozóként.[5] Az első, Benedek Dezső tervei szerint elkészült épületeket az 1900-as évek elejéről ismerjük.
Elnöke volt az Erzsébetvárosi Polgári Kaszinónak. A politikában is szerepet vállalt: Külső-Erzsébetváros képviselőjeként beválasztották a törvényhatósági bizottságba.[6] Az 1920-as évek elejétől a Vázsonyi Vilmos-féle Nemzeti Demokrata Polgári Párt vezetőségének tagja lett.[7]
63 éves korában hunyt el agyvérzésben. A Farkasréti temetőben helyezték örök nyugalomra, az unitárius egyház szertartása szerint.