Merckov indeks nakon Beilsteinove kolekcije najveća je svjetska enciklopedija kemijskih spojeva, lijekova i općenito tehnološki primjenjivih te za gospodarstvo važnih tvari s preko 10000 opisa na temu pojedinih supstanci ili srodnih grupa. Sadrži i dodatak s popisom fizikalnih veličina i jedinica, doziranja određenih tvari i kratki prikaz pojedinih organskih reakcija.

Knjigu izdaje američka farmaceutska kuća Merck. Vrlo je popularna u cijelom svijetu zbog svoje jednostavne i pregledne organizacije i neizostavna je na policama različitih instituta, fakulteta i bolnica. Doživjela je već četrnaest izdanja, a posljednje je u potpunosti digitalizirano te se na CD-u uz knjigu može naći i cijela baza podataka o tvarima opisanima u knjizi.

Tipična se referenca za pojedini spoj u Merck-ovom indeksu sastoji od sljedećih podataka (redom):

• CAS registar
• sinonimi spojeva i tradicionalna imena, te imena po pravilima IUPAC-a (Međunarodna unija za čistu i primijenjenu kemiju)
• kemijska formula
• molekulska masa
• maseni udio elemenata u spoju
• kratka povijest pronalaska i primjene
• strukturna formula (ako je jednostavna; izostavljeno za neke složene enzime)
• fizikalna svojstva (izgled, talište, vrelište, topljivost...)
• navode za drugu literaturu o tom spoju
• terapeutska kategorija, ako dolazi u obzir
• posebne napomene vezane uz rukovanje opisanom tvari (toksičnost...)

• 14. (2006.)
• 13. (2001.)
• 12. (1996.)
• 11. (1989.)
• 10. (1983.)
• 9. (1976.)
• 8. (1968.)
• 7. (1960.)
• 6. (1952.)
• 5. (1940.)
• 4. (1930.)
• 3. (1907.)
• 2. (1896.)
• 1. (1889.)

• Službene informacije  Arhivirana inačica izvorne stranice od 11. kolovoza 2008. (Wayback Machine)
• Merckov indeks