בזמן העצמאות בשנת 1993 אריתריאה הייתה מסודרת לעשרה מחוזות והם היו אסמרה (בירת אריתריאה), אקל'ה גוזאי, בארקה, דנקליה, גאש-סטית, חמאסיין, סאהל, סמהר, סנהיט וסריי. מחוזות אלו היו דומים לתשעת המחוזות שפעלו בתקופה הקולוניאלית. בשנת 1996 אוחדו אלה לשישה אזורים (זובאס). הגבולות של אזורים חדשים אלה מבוססים על אגני היבול. מבקרי מדיניות זו טוענים שממשלת אריתריאה מחקה את המרקם ההיסטורי של אריתריאה בעוד התומכים מאמינים שגבולות אזוריים חדשים אלה יקלו על סכסוכי קרקע היסטוריים. יתר על כן, התומכים במדיניות זו טוענים כי ביסוס גבולות על משאב טבע חשוב יקל על תכנון השימוש בו.