מועדון הכדורגל טוסנו הוקם לראשונה במרץ 2013 ביוזמת חברת ההחזקות Fort Group[2][3] וכבר בעונת הבכורה שלה הורשתה להתמודד בליגה הרוסית השנייה.
בעונת 2013/2014 הקבוצה התמודדה במקביל גם בגביע הרוסי והעפילה עד לשלב רבע גמר הגביע והיה למועדון הכדורגל הראשון ממחוז לנינגרד שהגיע למעמד זה. מאמן הקבוצה בעונת הבכורה היה ויקטור דמידוב.[4] הוא הוחלף באמצע העונה על ידי קיריל גשיצ'ב.
בפברואר 2014 מונה אולג לשצ'ינסקי למאמן הקבוצה.[5] תחת הדרכתו העפילה הקבוצה לשמינית גמר הגביע הרוסי והדיחה באופן סנסציוני את קבוצת הפאר ספרטק מוסקבה[6] ושוב העפילה לרבע גמר הגביע,[7] ברם הקבוצה כשלה בנסיונותיה להעפיל לחצי גמר הגביע לאחר שהודחה על ידי קרסנודר.
ביולי 2014 מונה ניקולאי קוסטוב למאמן הקבוצה החדש[10][11] הקבוצה התייצבה בראשות הטבלה. בדצמבר 2014 מונה אלכסנדר גריגוריאן למאמן החדש.[12] בפברואר 2015 גריגוריאן הוחלף ביבגני פרברטיילו[13] אך הקבוצה לא הצליחה להתייצב בראשות הטבלה כדי להבטיח את העפלתה לפרמייר ליג ובאוגוסט 2015 הקבוצה החתימה מאמן חדש, את דמיטרי פארפיונוב[14][15]
בעונת 2015/2016 הקבוצה העפילה לשלב שמינית גמר הגביע הרוסי והצליחה לגבור על רוסטוב, אך נחלה תבוסה צורבת ברבע גמר משהודחה על ידי זניט סנקט פטרבורג שגברה עליה בתוצאה 5:0.
בעונת 2016/2017 הקבוצה התחזקה משמעותית והתייצבה במקום השני בבית בהפרש ניכר מהמקום השלישי. בגביע הרוסי הצליחה הקבוצה להעפיל לרבע גמר הגביע לאחר שגברה על ארסנל טולה ורוסטוב, אך הודחה על ידי לוקומוטיב מוסקבה, שגברה עליה בתוצאה 1:0. לקראת סיום העונה, הקבוצה התייצבה במקום השני והבטיחה את העפלתה לליגת העל הרוסית בכדורגל שלושה מחזורים לפני סיום העונה.[16][17]
בשנת 2018 הוקם בית ספר לכדורגל בשם "אטלנט טוסנו", במימון חברת Fort Group, שהחזיקה בעבר בבעלות על קבוצת האם.
הקמה מחדש
באפריל 2023, טוסנו הוקמה מחדש על בסיס אקדמיית "אטלנט טוסנו", בתמיכת עיריית טוסנו וממשלת נפת טוסנו של מחוז לנינגרד. המועדון נרשם להתמודדות באליפות מחוז לנינגרד במסגרת הליגה השלישית.
מגרש הבית
בשנתה הראשונה הקבוצה אירחה את משחקיה באצטדיון העירוני, הממוקם ברחוב אלכסייבה בעיר טוסנו במרחק 53 קילומטרים מהעיר סנקט פטרבורג ומכיל 250 מושבים בלבד. האצטדיון שנחנך בשנת 1988 שימש את הקבוצה כמתקן האימונים שלה.
לאחר שהחלה להתמודד במסגרות המקצועניות הקבוצה אירחה את משחקיה באצטדיון קירובץ בעיר טיחווין שבמחוז לנינגרד, בשל חוסר באצטדיון ראוי בעיר טוסנו מאחר שהאצטדיון העירוני בטוסנו לא עומד בתקני הליגות המקצועניות. לאחר מכן עברה הקבוצה לארח את משחקיה בהיכל הספורט הקטן של אצטדיון פטרובסקי בסנקט פטרבורג.
בקיץ 2014 הנהלת הקבוצה הצהירה על כוונתה לבנות אצטדיון כדורגל משלה בעיר טוסנו[29] ברם, בהיעדר תמיכה מעיריית טוסנו ומממשלת מחוז לנינגרד בבניית האצטדיון, באפריל 2016 עברה הקבוצה לארח את משחקיה באצטדיון "אלקטרון" שבוליקי נובגורוד,[30][31] המכיל 3,223 מושבים.[32]
לאחר שהקבוצה העפילה לליגת העל, תחילה היה חשש כי בשל חוסר באצטדיון כדורגל ראוי בעיר טוסנו, ייתכן שהקבוצה לא תורשה ליטול חלק בליגה הבכירה, אך לבסוף הושג הסכם לפיו הקבוצה תארח את משחקיה באצטדיון פטרובסקי שבסנקט פטרבורג בעונת 2017/2018.[33][34][35][36][37][38]