הפלה היה "המתאם" של מבצע ריינהרד וסגנו של אודילו גלובוצניק (פרט שהופך את הפלה לשני בחשיבותו במבצע); תפקידו המוצהר היה "מומחה גירוש והשמדה". להפלה הייתה סמכות ראשית על המבצע מלבד למפקדו, גלובוצניק. בתחילת המבצע הוא היה בדרגת האופט-שטורמפיהרר. חברי האס אס שהשתתפו בתוכנית T4 - אותנסיה, וששובצו ברובם גם לתוכנית זו, דיווחו על פעולותיהם למטה הראשי בלובלין והיו כפופים להפלה. בין המסמכים המעטים שנמצאו ונקשרו למבצע ניתן למנות את מסמך הסודיות הבא, שעליו חתמו כל המשתתפים במבצע:
"יודעתי ותודרכתי ביסודיות על ידי אס אס האופט-שטורמפיהרר הפלה, כמפקד של המחלקה הראשית במבצע ריינהרד של מפקד האס אס והמשטרה במחוז לובלין:
1. שאסור לי בשום תנאי להעביר איזושהי צורת מידע, מילולית או בכתב, על ההתקדמות, התהליך או על תקריות בנוגע לפינוי היהודים לאדם כלשהו מחוץ לצוות מבצע ריינהרד.
2. שתהליך פינוי היהודים הוא נושא המוגדר בסיווג "מסמך רייך סודי", בהתאם לתקנות הרגולציה ורשל 5...
3. שישנו איסור מוחלט על העברת מכתבים במחנות מבצע ריינהרד;.....
אני מכיר בתקנות שהוכרזו לעיל ובחוקים, ואני מודע לאחריות שהוטלה עלי בנוגע למשימה שהוקצתה לי. אני מבטיח לפקח עליהם כמיטב ידיעתי ומצפוני. אני מודע שההתחייבות לשמור על סודיות נמשכת גם לאחר שאסיים את השירות.
כראש המחלקה הראשית (בגרמנית Hauptabteilung), הפלה היה אחראי על הארגון ועל כוח האדם של מבצע ריינהרד. הוא תיאם את גירוש היהודים מכל שטחי הגנרלגוברנמן והפנה אותם לאחד ממחנות ההשמדה הקרובים ביותר. הוראות הגירוש תואמו והועברו דרך רשויות האס אס ממשרדו של הפלה, שהוקם במסגרת תוכנית לובלין, ועד מפקדי האס אס והמשטרה בחשאיות עד ליישובים בהם בוצעו הגירושים.
בסביבות מאי 1942, בשטח הגנרלגוברנמן, הוחלפו בהדרגה פועלים פולנים שנשלחו לשטחי הרייך הגרמניבפועלי כפייה יהודים. הליך שגרתי בתקופה זו היה עצירה של רכבות גירוש מהרייך ומסלובקיה בלובלין על מנת לבחור את היהודים הכשירים לעבוד בשטחי הממשל הכללי, בעוד היתר הוחזרו לרכבות והמשיכו למותם במחנה בלז'ץ. כך חייהם של מספר יהודים "הומתקו" בעבודת כפייה במקום מוות במחנות הריכוז. הרמן הפלה בעצמו היה מהתומכים הראשיים במדיניות זו.
הפלה פיקח במו עיניו על ביצוע גירוש גטו ורשה, מבצע שקיבל בפי אנשי האס אס את הכינוי "האקציה הגדולה". למבצע זה קדם פרץ של רציחות אקראיות של יהודים ברחובות הגטו בתאריכים 20–21 ביולי 1942, וכן מעצרים ומאסרים אכזריים של חברי המועצה היהודית, מנהלי דירות ואחרים מבין היודנרט, במטרה להפחיד ודכא את היודנרט. למחרת בבוקר ה-22 ביולי, התייצב הפלה (שלווה בפמליית אנשי אס אס ובכירים בממשל הנאצי) בפני היודנרט בגטו ורשה והצהיר בפני ראש המועצה אדם צ'רניאקוב, שיהודים, ללא קשר לגילם או למינם מלבד מעטים יוצאים מהכלל, יפונו ליישוב מחדש במזרח. היוצאים מהכלל היו עובדים במפעלים גרמניים בעלי אישורי עבודה תקפים, חברים ביודנראט, חולים ועובדי בית החולים בגטו, ומשפחותיהם של הפטורים מגירוש. המגורשים הורשו לשאת עמם מטען של עד 15 קילוגרמים, מזון לשלושה ימים, כסף, זהב, וחפצי ערך אחרים. כמו כן, מדי יום על 6,000 מגורשים היה להתייצב ברחבת הגירוש בגטו, האומשלגפלאץ, בשעה ארבע בבוקר ולעלות על רכבות הגירוש.
אדם צ'רניאקוב רשם ביומנו ב-22 ביולי 1942 (וביום המחרת התאבד):
"שטורמבנפיהרר הפלה (האחראי על הגירוש) זימן אותי למשרדו ויידע אותי שלעת עתה אשתי הייתה חופשיה, אך אם הגירוש יתעכב באיזשהו אופן, היא תהיה הראשונה שתוצא להורג כבת ערובה."
— יצחק ארד (1987, "בלז'ץ, סוביבור, טרבלינקה")
הפלה היה דמות מרכזית גם באקציית ארנטפסט (בגרמנית: "מבצע חג הקציר") בה נטבחו אסירים שנלקחו ממחנות עבודה במחוז לובלין ב-3 בנובמבר1943. קרוב ל-43,000 נפשות נרצחו במהלך המבצע, שהיה הטבח היחיד הגדול ביותר שבוצע על ידי הגרמנים במהלך המלחמה.
הפלה הצטרף לגלובוצניק בטריאסטה, לאחר שסיים מספר משימות בהולנד ובבלגיה.
ב-31 במאי1945 מצאו הבריטים את הפלה במסתור בגרמניה. יחד עמו נמצאו בכירים נוספים בפלוגות הסער של האס אס. לאחר שנתיים במתקן חקירה של הבריטים, הוא שוחרר למערכת המשפט האוסטרית. ב-30 באוקטובר1947, תחת שבועה, הוא שוחרר כדי שיוכל לחזור לעיסוקו מלפני ימי המלחמה, מכונאי רכב, בעיר הולדתו זלצבורג.
הפלה חזר לזלצבורג וחי בה כאיש חופשי עד 2 בינואר1961. ביום זה הוא נעצר על ידי הרשויות באוסטריה, נשלח למאסר בווינה בשנת 1962, והתאבד בתלייה בטרם התחיל משפטו.
